甘藍(lán)型油菜、白菜、甘藍(lán)的BAC末端序列及EST序列分析.pdf

1、分類號(hào):華中農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文甘藍(lán)型油菜、白菜、甘藍(lán)的BAC末端序列及EST序列分析TheBAC一endandESTanalysisofBrassicanaPus、Brassicar即aandBrassicaoleracea研究生指導(dǎo)教師指導(dǎo)小組曹睿孟金陵教授孟金陵教授徐芳森教授龍艷博士專業(yè):作物遺傳育種研究方向:蕓苔屬作物基因組序列分析學(xué)獲得學(xué)位名稱:農(nóng)學(xué)碩士獲得學(xué)位時(shí)間:2010年6月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院二O一0年六月甘

2、藍(lán)型油菜、白菜、甘藍(lán)的BAC末端序列及EST序列分析3.3.2三物種BAC末端重復(fù)序列分析結(jié)果.................................................……203.3.3三物種BAC末端SSR分析................................................................……243.3.3.1三物種BAC末端SSR鑒定結(jié)果概況.……，......

3、........................……243.3.3.2三物種BAC末端不同重復(fù)單元的分布...................................……253.3.3.3三物種BAC末端SSR分布比較分析......................................……293.4甘藍(lán)型油菜BAC末端序列比對(duì)及在TN遺傳圖譜上的定位...................……313.4.1甘藍(lán)型油菜B

4、AC末端序列與擬南芥雙端比對(duì).................................……313.4.1.1甘藍(lán)型油菜BAC末端序列與擬南芥雙端比對(duì)流程及結(jié)果...……313.4.1.2基于與擬南芥的雙端比對(duì)結(jié)果進(jìn)行的遺傳圖譜定位.............……323.4.2甘藍(lán)型油菜BAC末端序列與白菜A3、Ag染色體的BAC序列比對(duì).343.4.2.1甘藍(lán)型油菜BAC末端序列與白菜A3、Ag的BAC比對(duì)流程及結(jié)果.......

5、......................................................................................................……343.4.2.2基于與白菜BAC雙端比對(duì)結(jié)果進(jìn)行的遺傳圖譜定位...........……363.5小結(jié)................................................................

6、......……，....................................……394、甘藍(lán)型油菜、白菜、甘藍(lán)的EST序列分析.......................................................……414.1三物種EST序列信息簡(jiǎn)介............................................................................

7、……414.1.1三物種EST序列信息來(lái)源..................................................................……414.1.2三物種EST序列信息概況.............……，..............................................……414.2三物種EST分析方法..............……:................

8、...............................................……414.2.1EST序列分析工具...............................................................................……414.2.2EST序列分析流程..........................................................

9、.....................……434.2.2.1EST序列的預(yù)處理.....................................................................……434.2.2.2EST序列的拼接及Unigene預(yù)測(cè)及SSR鑒定........................……434.2.2.3EST的ORF預(yù)測(cè)...............................

10、........................................……434.3三物種EST分析結(jié)果....................................................................................……454.3.1EST的拼接及UGMS鑒定結(jié)果..............................................……，....……