大豆胞囊線蟲病候選抗性基因Rhg4和GmHs1pro-1 SNP標記的開發(fā)應(yīng)用及抗性新基因的發(fā)掘.pdf

1、大豆胞囊線蟲(Soybean cyst nematode，SCN)給世界大豆生產(chǎn)造成了嚴重損失，抗病品種選育是目前最經(jīng)濟有效的防治方法，而發(fā)掘新抗性基因和鑒定新型抗病種質(zhì)是培育持久性抗病品種的根本保障。本研究分析了SCN候選抗性基因Rhg4和GmHs1pro-1的序列多態(tài)性，并將Rhg4和GmHs1pro-1中發(fā)現(xiàn)的8個SNP轉(zhuǎn)化成SNP標記，建立了FLDAS-PCR分型方法，分析了Rhg4、GmHs1pro-1在栽培大豆和野生大豆的S

2、NP分布特點及其與SCN抗性關(guān)系，并利用130個SSR標記和開發(fā)的8個SNP標記分析了41份大豆新種質(zhì)的基因型，為合理利用大豆種質(zhì)拓寬抗性遺傳基礎(chǔ)以及SNP標記輔助選擇提供理論依據(jù)和技術(shù)手段。
　　主要結(jié)果如下:
　　1、建立了FLDAS-PCR大豆SNP分型方法。該方法采用AS-PCR原理，針對單個SNP位點設(shè)計2個相差4～5bp的特異引物和1個公用引物，在2個特異引物3'端第3和4堿基位置分別人為引入錯配堿基來提高PCR

3、特異性。PCR產(chǎn)物約100bp或150bp，用6％變性聚丙烯酰胺凝膠電泳可同時檢測純合和雜合基因型。利用該方法已完成參試種質(zhì)的Rhg4和GmHs1pro-1的SNP分析。
　　2、明確了大豆Rhg4序列多態(tài)性及其與SCN抗性關(guān)系。大豆Rhg4序列多態(tài)性較高。Rhg4五個SNP位點1592、1724、1760、2120和2387在野生大豆、地方品種和選育品種間以及選育品種和核心種質(zhì)間的分布差異顯著，為核心種質(zhì)的補充和調(diào)整、利用野生大

4、豆和地方品種豐富抗性遺傳基礎(chǔ)提供了理論依據(jù)。上述5個SNP位點在抗、感種質(zhì)中的分布表明，Rhg4控制著大豆對SCN1、SCN3和SCN4的抗病作用。
　　3、明確了大豆GmHs1pro-序列多態(tài)性及其與SCN抗性關(guān)系。本研究獲得了全長1477bp的GmHs1pro-1。與Rhg4相比，GmHs1pro-1的序列多態(tài)性略低。栽培大豆多樣性明顯低于野生大豆，這可能是人為選擇的結(jié)果。3個SNP位點177、1036和1380在野生大豆與栽

5、培大豆間的分布差異顯著，為合理利用野生大豆拓寬大豆品種遺傳基礎(chǔ)提供了依據(jù)。上述3個SNP位點在SCN1、SCN3和SCN4抗、感種質(zhì)中的分布表明，GmHs1pro-1可能與大豆對SCN抗性無關(guān)。
　　4、發(fā)現(xiàn)了SCN4抗病基因新種質(zhì)。用130個SSR和8個基于Rhg4與GmHs1pro-的SNP標記分析了來自Hartwig×?xí)x品系的41份大豆新種質(zhì)，明確了其中31份抗病種質(zhì)的基因型。Hartwig與晉品系親本含有不同的SCN4抗病