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文檔簡介
1、黑升麻是一種生長在北美東部的毛莨科毛莨屬植物,其根莖提取物三萜皂苷類物質(zhì)多種具有生理活性。GABA受體是中樞神經(jīng)系統(tǒng)內(nèi)最主要的抑制性神經(jīng)遞質(zhì)受體,是多種藥物的作用靶標,同時又與多種人類的精神類疾病相關;HIV逆轉(zhuǎn)錄酶和HIV整合酶是抗艾滋病藥物設計的理想靶點。研究發(fā)現(xiàn),黑升麻根莖提取物對兩種受體蛋白均有抑制作用;為了闡明其抑制作用機理及指導新型藥物的研發(fā),本論文通過計算機模擬方法,對GABAA受體、HIV逆轉(zhuǎn)錄酶和HIV整合酶的結(jié)構(gòu)及其
2、與配體作用方式進行了探索研究,主要工作內(nèi)容包括:
1)利用分子對接和分子動力學模擬的方法,探索黑升麻根莖提取物三萜皂苷類化合物與大鼠GABAA受體的結(jié)合方式,并計算兩者的結(jié)合自由能,給出了其與GABAA受體的具體結(jié)合方式,明確了結(jié)合時起重要作用的氨基酸殘基,通過分析三萜皂苷類化合物與受體結(jié)合的作用模式,發(fā)現(xiàn)23-O-acetylshengmanol3-O-β-D-xylopyranoside同GABAA受體的結(jié)合力最強。<
3、br> 2)利用分子對接的方法,分別將黑升麻根莖提取物三萜皂苷類化合物與HIV逆轉(zhuǎn)錄酶、HIV整合酶進行對接,解釋黑升麻根莖提取物三萜皂苷類化合物抗艾滋病的作用機理。
3)利用同源建模的方法,以煙堿型乙酰膽堿受體蛋白(nAChR)為模板構(gòu)建了果蠅RDL同源五聚體通道模型。利用該模型對氟蟲腈及其衍生物進行了分子對接,探索氟蟲腈與昆蟲GABA受體的作用模式。
本論文在實驗數(shù)據(jù)的基礎上,采用分子模擬方法從分子
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