豬BMP7基因啟動子多態(tài)性及其與繁殖性狀關聯(lián)性分析.pdf

1、骨形態(tài)發(fā)生蛋白7(BMP7)是BMP家族成員之一,具有多方面的生物學活性,對動物繁殖機能具有重要的調(diào)控作用。因目前尚未見豬BMP7基因遺傳多態(tài)性分析的文獻報道,所以本研究首次對豬BMP7基因啟動子部位的遺傳變異特性及其與豬繁殖性狀相關性進行了分析。首先提取豬毛囊基因組DNA,選取不同品種極端性狀的個體100頭,構建極端性狀混合DNA池,通過測序的方法,對豬BMP7基因啟動子的遺傳變異位點進行篩選。在此基礎上,應用PCR-RFLP技術,對

2、3個品種255頭豬BMP7基因啟動子區(qū)的4個SNP位點T-3722C、A-3684G、C-3522G、A-1027G進行群體遺傳學分析,并用SPSS16.0分析這4個SNP位點對豬繁殖性狀的影響。主要研究結果如下:
　　 (1)應用豬毛囊提取的基因組DNA池,通過測序,首次發(fā)現(xiàn)啟動子區(qū)存在39個多態(tài)位點。
　　 (2)以豬BMP7基因測序結果為基礎,應用PCR-RFLP技術首次檢測啟動予區(qū)4個SNP位點T-3722C、A

3、-3684G、C-3522G和A-1027G。測序結果表明4個SNP位點分別為T/C突變、A/G突變、C/G突變和A/G突變,4個位點都有2個等位基因,3種基因型。遺傳變異分析發(fā)現(xiàn),T-3722C位點T是優(yōu)勢等位基因(0.67),優(yōu)勢基因型為TC型(0.48),該位點處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),多態(tài)信息含量(PIC)、雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)分別為0.34、0.44、1.80,屬中度多態(tài)。A-3684G位點G

4、是優(yōu)勢等位基因(0.84),優(yōu)勢基因型為GG型(0.76),該位點處于Hardy-Weinberg非平衡狀態(tài),PIC、He、Ne分別為0.23、0.27、1.36,屬低度多態(tài)。C-3522G位點c是優(yōu)勢等位基因(0.71),優(yōu)勢基因型為CG型(0.48),該位點處于Hardy—Weinberg非平衡狀態(tài),PIC、He、Ne分別為0.33、0.41、1.70,屬中度多態(tài)。A-1027G位點A是優(yōu)辨等位基因(0.81),優(yōu)勢基因型為AA型(

5、0.67),該位點處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),PIC、He、Ne分別為0.26、0.31、1.44,屬中度多態(tài)。
　　 (3)將檢測到的4個SNP位點與繁殖性狀相關的生產(chǎn)數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析。結果顯示,A-3684G位點與豬繁殖性狀進行關聯(lián)分析均表現(xiàn)無顯著關聯(lián)(P>0.05)。T-3722C位點與產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重及21日齡窩重顯著相關(P<0.05);TT和TC型產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重及21日齡窩重均極顯著高于CC型。

6、C-3522G位點與21日齡窩重極顯著相關(P<0.01),CC和CG型極顯著低于GG型。A-1027G位點與產(chǎn)活仔數(shù)及出生窩重顯著相關(P<0.05),AA和AG型顯著高于GG型。應用TFsearch等在線程序對豬BMP7啟動子進行分析,預測到3個與繁殖性狀顯著關聯(lián)的SNP位點均正好位于或靠近某些重要轉錄因子結合位點,而與繁殖性狀無關聯(lián)的位點則不在可能的轉錄因子結合位點區(qū)域。
　　 基于以上結果,可得出如下結論: