豬BMP7基因啟動(dòng)子多態(tài)性及其與繁殖性狀關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、骨形態(tài)發(fā)生蛋白7(BMP7)是BMP家族成員之一,具有多方面的生物學(xué)活性,對(duì)動(dòng)物繁殖機(jī)能具有重要的調(diào)控作用。因目前尚未見(jiàn)豬BMP7基因遺傳多態(tài)性分析的文獻(xiàn)報(bào)道,所以本研究首次對(duì)豬BMP7基因啟動(dòng)子部位的遺傳變異特性及其與豬繁殖性狀相關(guān)性進(jìn)行了分析。首先提取豬毛囊基因組DNA,選取不同品種極端性狀的個(gè)體100頭,構(gòu)建極端性狀混合DNA池,通過(guò)測(cè)序的方法,對(duì)豬BMP7基因啟動(dòng)子的遺傳變異位點(diǎn)進(jìn)行篩選。在此基礎(chǔ)上,應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù),對(duì)

2、3個(gè)品種255頭豬BMP7基因啟動(dòng)子區(qū)的4個(gè)SNP位點(diǎn)T-3722C、A-3684G、C-3522G、A-1027G進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析,并用SPSS16.0分析這4個(gè)SNP位點(diǎn)對(duì)豬繁殖性狀的影響。主要研究結(jié)果如下:
　　 (1)應(yīng)用豬毛囊提取的基因組DNA池,通過(guò)測(cè)序,首次發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子區(qū)存在39個(gè)多態(tài)位點(diǎn)。
　　 (2)以豬BMP7基因測(cè)序結(jié)果為基礎(chǔ),應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)首次檢測(cè)啟動(dòng)予區(qū)4個(gè)SNP位點(diǎn)T-3722C、A

3、-3684G、C-3522G和A-1027G。測(cè)序結(jié)果表明4個(gè)SNP位點(diǎn)分別為T(mén)/C突變、A/G突變、C/G突變和A/G突變,4個(gè)位點(diǎn)都有2個(gè)等位基因,3種基因型。遺傳變異分析發(fā)現(xiàn),T-3722C位點(diǎn)T是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.67),優(yōu)勢(shì)基因型為T(mén)C型(0.48),該位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),多態(tài)信息含量(PIC)、雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)分別為0.34、0.44、1.80,屬中度多態(tài)。A-3684G位點(diǎn)G

4、是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.84),優(yōu)勢(shì)基因型為GG型(0.76),該位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg非平衡狀態(tài),PIC、He、Ne分別為0.23、0.27、1.36,屬低度多態(tài)。C-3522G位點(diǎn)c是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.71),優(yōu)勢(shì)基因型為CG型(0.48),該位點(diǎn)處于Hardy—Weinberg非平衡狀態(tài),PIC、He、Ne分別為0.33、0.41、1.70,屬中度多態(tài)。A-1027G位點(diǎn)A是優(yōu)辨等位基因(0.81),優(yōu)勢(shì)基因型為AA型(

5、0.67),該位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),PIC、He、Ne分別為0.26、0.31、1.44,屬中度多態(tài)。
　　 (3)將檢測(cè)到的4個(gè)SNP位點(diǎn)與繁殖性狀相關(guān)的生產(chǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示,A-3684G位點(diǎn)與豬繁殖性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析均表現(xiàn)無(wú)顯著關(guān)聯(lián)(P>0.05)。T-3722C位點(diǎn)與產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重及21日齡窩重顯著相關(guān)(P<0.05);TT和TC型產(chǎn)產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重及21日齡窩重均極顯著高于CC型。

6、C-3522G位點(diǎn)與21日齡窩重極顯著相關(guān)(P<0.01),CC和CG型極顯著低于GG型。A-1027G位點(diǎn)與產(chǎn)活仔數(shù)及出生窩重顯著相關(guān)(P<0.05),AA和AG型顯著高于GG型。應(yīng)用TFsearch等在線(xiàn)程序?qū)ωiBMP7啟動(dòng)子進(jìn)行分析,預(yù)測(cè)到3個(gè)與繁殖性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)均正好位于或靠近某些重要轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),而與繁殖性狀無(wú)關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)則不在可能的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)區(qū)域。
　　 基于以上結(jié)果,可得出如下結(jié)論: