小麥幼穗發(fā)育的轉錄組和miRNA調控網(wǎng)絡分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、禾本科作物花序的早期發(fā)育是決定每穗最終籽粒數(shù)的關鍵，進而影響作物的產(chǎn)量。目前，人們對花序發(fā)育分子調控的認識大多來自于模式植物擬南芥和水稻，普通小麥（Triticum aestivum L）該過程基因表達譜系統(tǒng)分析尚未報道。為了更好地了解小麥花序發(fā)育的分子調控路徑，本研究選取小穗分生組織形成期、小花分生組織形成期、藥隔原基形成期和花器官分化后的幼穗，對其進行mRNA和小分子RNA轉錄組測序。ARGONAUTE蛋白在小分子RNA介導的基因沉

2、默中起關鍵作用，轉錄組測序發(fā)現(xiàn)ARGONA UTE1d(AGO1d)在藥隔原基形成期特異高表達，于是對其功能進行了鑒定。
　　1共19060個基因在四個階段間差異表達，24個k-means聚類呈現(xiàn)出多種表達趨勢。小穗分生組織形成期、小花分生組織形成期、藥隔原基形成期和四分體時期分別含464、357、428和5799個階段特異表達的基因，其中包括參與擬南芥和水稻小穗分生組織和小花分生組織形成以及花器官分化的重要轉錄因子。很多花器官發(fā)

3、育相關的基因在水稻和小麥間保守，而小穗分生組織形成或分枝相關的基因表達趨勢有所不同。
　　2miR159、miR319、miR396和miR167等擬南芥花器官發(fā)育相關的miRNA在小麥幼穗中高表達，并與其靶基因的表達趨勢相反。RNA連接酶介導的5'RACE證明miRNA對其靶基因存在體內切割，說明花器官發(fā)育過程中miRNA介導的調控機制可能與擬南芥和水稻保守。
　　3花藥發(fā)育過程中，AGO1d先后在雄蕊原基和花藥絨氈層細胞

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