植物數(shù)量性狀分離分析Windows軟件包SEA的研制.pdf

1、剖析植物數(shù)量性狀遺傳體系對作物遺傳和育種工作具有重要意義。然而，原植物數(shù)量性狀分離分析DOS版本計算軟件的操作性、算法和功能模塊等方面都存在一定缺陷。為此，在Microsoft Visual Studio 2010操作平臺下，利用C++語言研制Wndows界面友好的植物數(shù)量性狀分離分析軟件包是十分必要的。
　　植物數(shù)量性狀分離分析軟件Windows版本軟件包簡稱SEA是源于分離segregation前兩字母和分析analysis首

2、字母。SEA軟件包的主要研究內(nèi)容包括:
　　1)與DOS版本軟件相比較，做了如下改進(jìn):增加了模型選擇功能;利用Clapack V3.1.1求約束條件線性方程組的解和遺傳參數(shù)的最小二乘估計;調(diào)用庫Boost V1.51.0計算似然函數(shù)、概率和均勻性檢驗(yàn)的概率;精確計算了Smirnov檢驗(yàn)nW2和Kolmogorov檢驗(yàn)Dn的概率;將所有結(jié)果合并在一個Excel表格中，變化了輸出格式;根據(jù)個體或家系數(shù)量性狀表型值確定其主基因基因型的B

3、ayesian后驗(yàn)概率。通過與SAS計算比較表明:Clapack求線性方程的解和遺傳參數(shù)的最小二乘估計，Boost計算似然函數(shù)、概率分布函數(shù)與均勻性檢驗(yàn)概率，與SAS相應(yīng)計算結(jié)果無差異。SEA軟件包界面更友好，操作更簡便，計算更穩(wěn)定，結(jié)果更全面;
　　2)SEA軟件包主要有單世代分離分析軟件、多世代聯(lián)合分離分析軟件和分離世代個體后驗(yàn)概率分析軟件(GClasser)。單世代分離分析軟件包括F2單世代分離分析軟件(SEA-F2)、F2

4、∶3單世代分離分析軟件(SEA-F3)、回交衍生家系B1∶2和B2∶2分離分析軟件(SEA-BCF)和回交自交系BIL分離分析軟件(SEA-BIL);多世代聯(lián)合分離分析軟件包括P1、P2、F1和F2四世代聯(lián)合分離分析軟件(SEA-G4F2)、P1、P2、F1和F2∶3四世代聯(lián)合分離分析軟件(SEA-G4F3)、P1、P2、F1、B1∶2和B2∶2分離分析軟件(SEA-G5BCF)和P1、P2、F1、F2和F2∶3五世代聯(lián)合分離分析(SE