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1、蛋白質(zhì)是細(xì)胞生命活動(dòng)所必需的蛋白質(zhì),是生物體生存和繁殖不可或缺的一部分。蛋白質(zhì)的識(shí)別不僅對(duì)于生命科學(xué)的研究具有重要意義,而且對(duì)于疾病診治和藥物設(shè)計(jì)也具有重要的應(yīng)用價(jià)值。在后基因組時(shí)代,隨著高通量技術(shù)的發(fā)展,可獲得的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)日益豐富,基于蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的蛋白質(zhì)識(shí)別方法受到越來(lái)越多人的關(guān)注。
本研究主要內(nèi)容包括:⑴深入分析蛋白質(zhì)測(cè)度參數(shù)DC,BC,CC,SC,EC,IC,BN,DMNC,SoECC和LAC,并將這些測(cè)
2、度參數(shù)分別應(yīng)用于酵母蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò),實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明僅僅依靠蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的識(shí)別方法對(duì)網(wǎng)絡(luò)的依賴性較強(qiáng),缺少對(duì)于網(wǎng)絡(luò)噪聲(例如假陽(yáng)性相互作用)的容錯(cuò)能力。⑵針對(duì)單純依靠節(jié)點(diǎn)中心性測(cè)度識(shí)別蛋白質(zhì)對(duì)于網(wǎng)絡(luò)可靠性依賴性較大這一問(wèn)題,本文利用邊聚集系數(shù)測(cè)度節(jié)點(diǎn)的共簇程度,利用皮爾遜相關(guān)系數(shù)測(cè)度蛋白質(zhì)/基因共表達(dá)的程度,提出了一種融合蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)涮匦院突虮磉_(dá)數(shù)據(jù)來(lái)識(shí)別蛋白質(zhì)的中心性測(cè)度參數(shù)PeC?;诮湍傅鞍踪|(zhì)網(wǎng)絡(luò)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,相較于其他蛋白質(zhì)識(shí)別方法
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