Acidithiobacillus ferrooxidans對酸脅迫與有機萃取物P204脅迫應答及其機理研究.pdf

1、Acidithiobacillus ferrooxidans(A.ferrooxidans)是生物冶金過程中的典型菌株，在實際的工業(yè)應用中，生物冶金細菌群落常常處于非適宜的環(huán)境中，如環(huán)境酸度過高或是受到有機萃取物的脅迫，給細菌正常的代謝與功能帶來一定脅迫。生物冶金過程中，細菌保持正常生理活動是十分關鍵的一環(huán)。因此，研究工業(yè)常見的過酸環(huán)境下以及有機萃取劑脅迫下浸礦微生物的特性具有重大意義。本研究中選用浸礦典型菌株A.ferrooxidan

2、s進行研究，鑒于自養(yǎng)菌A.ferrooxidans與異養(yǎng)菌Acidiphilum Acidophilum(Aph.acidophilum)常共同生長，并有報道稱在以亞鐵為能源物質情況下之間存在某種協(xié)同生長機制，并輔以A.ferrooxidans與Aph.acidophilum的共培養(yǎng)浸礦微生物體系進行研究。
　　 本文應用基因芯片技術從基因表達層面全面剖析A.ferrooxidans在酸脅迫下的抗性機制。研究表明A.ferroo

3、xidans對無機酸的耐受過程主要涉及四個層次，即細胞膜結構、物質轉運、物質與能量代謝、調節(jié)功能:通過誘導Omp85(細胞膜中插入蛋白和脂質的必要組件)控制細胞膜成分變化，從細胞膜的結構上發(fā)生變化以適應或抵抗酸脅迫帶來的負面影響;通過上調相關的轉運蛋白(plasma-membraneproton-efflux P-type ATPase/質膜質子外排P型ATP酶，AFE0818)，并下調ATP合酶、鉀離子和氨離子的轉運蛋白控制質子的內流

4、;誘導表達相關于胞內pH緩沖的部分基因如，堿性化合物通道蛋白(carbonic anhydrase/碳酸酐酶)以中和胞內多余質子以達到緩沖pH目的;強烈誘導抗壓轉錄因子RpoS的表達，進而啟動相關抵抗環(huán)境壓力的啟動子，實現(xiàn)細胞轉錄控制水平的調節(jié)。
　　 對于A.ferrooxidans與Aph.acidophilum的共培養(yǎng)浸礦微生物體系，在以硫為能源物質的條件下，生長前期A.ferrooxidans占生長優(yōu)勢，但當達到A.fe

5、rrooxidans的穩(wěn)定期時Aph.acidophilum快速進入對數(shù)期且菌數(shù)超出了A.ferrooxidans，之后A.ferrooxidans迅速進入生長后期衰亡期，至此Aph.acidophilum成為此體系中的優(yōu)勢菌種。故而推斷出在以硫為能源物質的條件下Aph.acidophilum的生長依賴于A.ferrooxidans，然而Aph.acidophilum的快速生長會對A.ferrooxidans的生長帶來負面的影響。

6、>　　 受到有機酸萃取劑P204的刺激下，本研究中利用實時定量PCR技術探究了A.ferrooxidans中相關基因的表達差異，在A.ferrooxidans單獨培養(yǎng)條件下以及與Aph.acidophilum的共培養(yǎng)條件下體現(xiàn)出不同的抗性。在A.ferrooxidans單獨培養(yǎng)條件下受到有機酸P204脅迫時，根據(jù)能表現(xiàn)細胞應對外界刺激的指標RpoS的表達情況，即呈現(xiàn)隨脅迫時間增加而被誘導的趨勢，且其他相關抗性機制基因的表達情況相類似如

7、細胞膜脂雙層上形成離子通道的Omp40、與細胞膜的磷脂層合成有關Phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase(磷酸庚糖異構酶/胞苷酰轉移酶)、負責切斷C-P鍵的磷酸酶亞基PhnL和PhnK以及Universal stress family protein(應激家族蛋白:AFE2259，AFE2183，AFE2133)，可以推斷A.ferrooxidans在有機酸P204脅迫下能夠啟動相關積極

8、反應機制應對外界脅迫，但此反應只在A.ferrooxidans被脅迫一段時間后被激發(fā)(約10至20分鐘)。
　　 在A.ferrooxidans與Aph.acidophilum的共培養(yǎng)條件下，根據(jù)能表現(xiàn)細胞應對外界刺激的指標RpoS的表達情況(受到脅迫10分鐘時被誘導而后脅迫持續(xù)至20分鐘又下調)，以及其他相關基因在共培養(yǎng)條件下中的表達情況(其他兩個轉錄因子除RpoE在脅迫5分鐘被輕微誘導外都未有顯著的表達變化，RpoE、Uni

9、versal stress familyprotein(應激家族蛋白，AFE2183)和PhnK在共培養(yǎng)條件下被脅迫5分鐘時被輕微誘導但之后都被抑制或是輕微誘導)，并且結合共培養(yǎng)物在受到有機酸P204脅迫下的生長曲線變化，即A.ferrooxidans數(shù)目迅速下降而Aph.acidophilum的快速生長被抑制在一定水平，可以得出推斷A.ferrooxidans內相關的應對有機酸P204脅迫的積極反應機制未被啟動，或短時間內A.ferr