2009～2014年福建省甲型H1N1流感病毒分子流行病學(xué)特征研究.pdf

1、目的：
　　本研究通過對2009～2014年福建省甲型H1N1流感（甲流）病毒的分子流行病學(xué)特征進(jìn)行分析，結(jié)合本省流感的監(jiān)測情況，旨在探索該病毒在我省的基因變異和分子特征，掌握流感流行的趨勢，為預(yù)測疫苗的防治效果及防控甲流疫情提供科學(xué)依據(jù)。
　　方法：
　　收集106株源自福建省各哨點(diǎn)醫(yī)院流感樣病例的甲流病毒毒株，通過RT-PCR和測序方法獲得HA和NA基因的全長序列。運(yùn)用分子生物學(xué)軟件和統(tǒng)計學(xué)軟件對序列進(jìn)行拼接、比對

2、和分析，以甲流病毒疫苗株 A/California/07/2009(H1N1)為參考毒株，從多個方面對我省甲流的分子流行病學(xué)進(jìn)行研究，結(jié)合流感監(jiān)測數(shù)據(jù)來揭示甲流在我省的流行規(guī)律和變異特征。
　　結(jié)果：
　　1、2009～2014年福建省甲流經(jīng)歷了流行消長的反復(fù)過程，近兩年的流行強(qiáng)度更是加大，2014年下半年處于流行低谷，但很有可能迎來新的流行高峰。
　　2、同源進(jìn)化分析顯示，福建省甲流病毒HA基因與疫苗株的核苷酸和氨基

3、酸的同源性分別在97.6％～99.6%和97.2%～99.1%之間；NA基因則分別在98.7%～99.6%和97.4%～99.6%之間。隨著時間的推移，HA基因和NA基因的進(jìn)化樹均逐漸形成6個分支，HA蛋白上的S143G、H138R、V249L、V234I、K163Q、S185T、S451N和NA蛋白上的K432E、V241I發(fā)生突變可能是導(dǎo)致毒株聚集成不同分枝的重要原因，其中H138R和S143G分別位于抗原決定簇Ca上和其周圍，K1

4、63Q和S185T則分別位于抗原決定簇Sa和Sb上。
　　3、抗原性分析顯示，2009～2014年期間福建省甲流病毒 HA蛋白中共有97個氨基酸位點(diǎn)發(fā)生變化，其中有17個氨基酸位點(diǎn)，變異累計涉及4個抗原決定簇，也有部分毒株在190螺旋和220環(huán)上位點(diǎn)發(fā)生變異，從2012年開始，毒株相對疫苗株出現(xiàn)了較大的變異，氨基酸位點(diǎn)的變異個數(shù)均超過10個。福建省近年來的甲流毒株已經(jīng)出現(xiàn)了抗原漂移現(xiàn)象?？乖浦昱c非抗原漂移株在NA基因第34、4

5、4、200、241、321、369、386和432位點(diǎn)上的變異存在統(tǒng)計學(xué)差異。
　　4、在本次甲流毒株中發(fā)現(xiàn)了D222G和Q293H位點(diǎn)的突變，但并未增強(qiáng)病毒毒力，所有毒株均表現(xiàn)為低致病性。
　　5、本次研究中發(fā)現(xiàn)了“達(dá)菲”耐藥位點(diǎn) H275Y，并伴有可能會增強(qiáng) H275Y突變株NA酶活性及蛋白表達(dá)的V241I和N369K的同時突變。
　　6、有3個毒株的HA蛋白上均增加一個位于抗原決定簇Sa內(nèi)的糖基化位點(diǎn)NKS162

6、-164或NQS162-164，其中2個毒株源于暴發(fā)疫情。在毒株中發(fā)現(xiàn)可能與耐藥相關(guān)的NA上的糖基化位點(diǎn) NQS42-44的增加，在毒株A/Fujianfuzhou/SWL11724/2009(H1N1)上也發(fā)現(xiàn)了可能會影響病毒的組織嗜性尤其是神經(jīng)嗜性的NA蛋白的NGT146-148位點(diǎn)的缺失。
　　結(jié)論：
　　福建省甲流病毒已悄然發(fā)生遺傳變異和分子進(jìn)化，與疫苗的同源性隨著時間的推移逐漸降低，并出現(xiàn)了51株抗原漂移株，且在N