長非編碼RNA HOTAIR單核苷酸多態(tài)性與中國人群肝癌遺傳易感性.pdf

1、背景與目的:長鏈非編碼RNA HOTAIR是近幾年被發(fā)現(xiàn)的一類長度超過200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNA分子，在多種腫瘤組織中都呈現(xiàn)顯著性表達(dá)上調(diào)。HOTAIR能夠招募染色體重構(gòu)復(fù)合物PRC2到指定的染色體位置，使得與腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因表達(dá)上調(diào)，從而促使腫瘤轉(zhuǎn)移的發(fā)生。本研究首次系統(tǒng)研究了HOTAIR基因座位功能性單核苷酸多態(tài)性(SNP)，及其與中國人群肝癌易感性的相關(guān)關(guān)系。
　　 方法:本研究首先通過生物信息學(xué)手段挑選中國人群

2、中HOTAIR基因的標(biāo)簽SNP，進(jìn)而采用病例-對(duì)照研究策略分析上述SNP與肝癌遺傳易感性的關(guān)系。在對(duì)性別和年齡匹配的肝癌病人和正常對(duì)照進(jìn)行基因分型后，利用Logistic回歸分析來分析相關(guān)SNP與肝癌發(fā)生的相關(guān)關(guān)系。針對(duì)HOTAIR基因內(nèi)含子2區(qū)段基因表達(dá)調(diào)控區(qū)的一個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行功能研究。設(shè)計(jì)克隆相關(guān)目的片段的PCR引物，將PCR產(chǎn)物連入T載體，雙酶切pGL3-Basic質(zhì)粒和上述連接有目的片段的T載體質(zhì)粒，回收相關(guān)DNA片段后，利用

3、T4連接酶連接，轉(zhuǎn)化后測序鑒定，進(jìn)而利用定點(diǎn)突變?cè)噭┖袑①|(zhì)粒SNP位點(diǎn)突變成不同的基因型。之后，將野生型和突變型報(bào)告基因質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)染HepG2和SMMC-7721肝癌細(xì)胞后檢測其雙熒光素酶活性。
　　 結(jié)果與結(jié)論:HOTAIR基因在中國人群中存在3個(gè)標(biāo)簽SNP，其中攜帶有CC基因型的rs920778與肝癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)具有相關(guān)性，相對(duì)于TT基因型使得肝癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加了53％(OR=1.53，95％CI=1.02-2.29);位于內(nèi)含