檸條錦雞兒CBF-DREB1轉錄因子cDNA全長的克隆及生物信息學分析.pdf

1、溫度是制約植物生長及分布的重要生態(tài)因子之一，過低的溫度會使植物受到傷害。低溫是導致我國北方許多地方農作物減產的重要因素。當低溫傷害發(fā)生的時候，CBF/DREB1(C-repeat/dehydration responsive binding factor/dehydration resistanceelement binding protein 1)基因被迅速誘導表達，激活各種抗寒機制及抗凍蛋白的轉錄翻譯，有效阻止了低溫對植物的傷害。

2、 本文利用簡并RT-PCR和RACE方法首次克隆了檸條錦雞兒(CaraganaKorshinkii Kom)CBF/DREB1基因cDNA全長序列。該序列全長996bp，包括615bp完整的開放閱讀框(ORF)，124bp的5'UTR，246bp的3UTR，加尾信號AATAAA及poly(A)11，起始密碼子ATG，終止密碼子TAA。對檸條錦雞兒CBF/DREB1氨基酸序列的生物信息學分析表明，該蛋白屬于CBF家族，具有AP2結合

3、域，且AP2域的兩端擁有CBF家族特有的PKK/RPAGRxKFxETRHP和DSAWR短多肽序列；有酸性氨基酸組成的潛在轉錄激活區(qū)域，存在核定位信號序列:無信號肽，無跨膜結構，具有CBF家族保守的α螺旋區(qū)域和β折疊區(qū)域，主要存在于細胞核中。通過對檸條錦雞兒CBF/DREB1與其它植物來源的蛋白全序列及其AP2區(qū)域的比較發(fā)現:AP2區(qū)域在雙子葉植物中高度保守，與檸條錦雞兒CBF/DREB1親緣關系最近的是大豆的GmCBF和勞豆的GsCB