炎癥信號通路相關(guān)基因多態(tài)性與強直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、目的:強直性脊柱炎（ankylosing spondylitis，AS）是一種慢性炎癥性自身免疫疾病。以往研究證明其與細胞因子TNF-α和某些炎癥相關(guān)因子關(guān)系密切。而A20和IL-12與TNF-α在功能上相關(guān)。通過炎癥信號通路上相關(guān)的分子來進行疾病易感基因的關(guān)聯(lián)研究已成為一種新的尋找疾病候選基因的方法。本研究通過選擇基因A20上的3個SNPs和細胞因子IL-12通路上的IL12B、IL12RB2、JAK2、STAT3、STAT2、STA

2、T4基因及其基因附近的15個SNPs，共18個SNPs組成的炎癥信號通路進行病例-對照關(guān)聯(lián)研究，尋找與AS相關(guān)的易感基因，探討AS可能的遺傳病因。
　　 方法:采用新型基因分型方法HRM與傳統(tǒng)的分型方法PCR-RFLP首先在吉林漢族人群中對篩選的18個SNPs進行56：56病例-對照研究，分析基因型，尋找陽性點。隨后在寧夏漢族人群298名AS散發(fā)患者和339名對照中進行復(fù)制研究。
　　 結(jié)果:（1）炎癥信號通路上18個S

3、NPs的基因型分析中僅見rs 610604與AS有關(guān)聯(lián)（P=0.031），其余17個SNPs在吉林病例-對照研究中等位基因頻率的分布差異無顯著性，P值均>0.05。（2）5號染色體的單倍型分析：rs 17728338、rs 3212227、rs 3213094組成的單倍型GAG（P=0.02；OR=1.896,95％ CI：1.102-3.264），rs 17728338、rs 6887695、rs 3212227組成的單倍型GGA（P

4、=0.013；OR=2.016，95％ CI：1.159-3.508），rs 6887695和rs 3212227組成的單倍型GA（P=0.03；OR=1.806，95％ CI：1.056-3.090），rs 3212227、rs 3213094組成的單倍型AG（P=0.023；OR=1.852，95％ CI：1.088-3.152）在吉林漢族人群病例和對照中分布具有顯著性差異，且AS組攜帶這些單倍型的頻率顯著地高于對照組。5號染色體的

5、正關(guān)聯(lián)單倍型中，只有rs3212227野生型等位基因A一致性存在于這四個單倍型中，A可能是構(gòu)成導(dǎo)致吉林人群中個體對AS易感的單倍型的主要等位基因。（3）A20基因的單倍型分析：rs 5029939、rs 2230926、rs 610604組成的單倍型CTC（P=0.039；OR=2.732，95％ CI：1.019-7.323），rs 5029939和rs 610604組成的單倍型CC（P=0.039；OR=2.732，95％ CI：1

6、.019-7.323），rs 2230926和rs 610604組成的單倍型TC（P=0.025；OR=2.944，95％ CI：1.107-7.830）在吉林漢族人群病例和對照中分布存在顯著性差異，且AS組的攜帶率顯著地高于對照組。在正關(guān)聯(lián)單倍型中，只有rs 610604野生型等位基因C一致性存在于這三個單倍型中，C可能是構(gòu)成導(dǎo)致吉林人群中個體對AS易感的單倍型的主要等位基因。 （4）經(jīng)過在寧夏漢族病例-對照中驗證發(fā)現(xiàn)：rs 6106

7、04的CC基因型頻率與AS有關(guān)聯(lián)（2.68％ vs 0.59％，P1/2=0.034），進一步經(jīng)兩人群組合分析，CC基因型得到與AS顯著性關(guān)聯(lián)的證明（Pjiont值=0.037）。
　　 結(jié)論:（1）炎癥信號通路上，5號染色體IL12B基因的rs 3212227、rs 3213094、rs6887695和rs 17728338組成的單倍型區(qū)域或其周圍可能存在與AS真正關(guān)聯(lián)的變異，在正關(guān)聯(lián)單倍型中，rs3212227野生型等位基因

8、A一致性存在于四個正關(guān)聯(lián)單倍型中，A可能是構(gòu)成導(dǎo)致吉林人群中個體對AS易感的單倍型的主要等位基因。（2）A20基因rs 5029939、rs 2230926、rs 610604組成的單倍型區(qū)域或其周圍可能存在與AS真正關(guān)聯(lián)的變異，在正關(guān)聯(lián)單倍型中，只有rs 610604野生型等位基因C一致性存在于三個正關(guān)聯(lián)單倍型中，C可能是構(gòu)成導(dǎo)致吉林人群中個體對AS易感的單倍型的主要等位基因。（3）經(jīng)兩個群體的合并分析表明，rs 610604的CC基