預測并驗證HSV-I基因組中的microRNA.pdf

1、mieroRNA(miRNA)，即微小RNA，是一類長約22個核苷酸的小分子非編碼RNA，通常與靶基因mRNA的3'UTR發(fā)生不完全互補，在轉錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達。自2000年首次報道以來，對microRNA的研究進展迅速，全世界有很多研究小組致力于研究microRNA在各個物種間的分布情況和它所發(fā)揮的重要作用。近幾年的研究表明，這是一種高度保守的、廣泛存在于植物、動物、病毒中的調(diào)節(jié)機制，在生長發(fā)育、器官的形成、癌癥的發(fā)生和病毒感染等

2、過程中扮演重要的角色。microRNA的發(fā)現(xiàn)是對經(jīng)典的遺傳學法則的重要補充。 HSV-I(herpes simplex virus 1)是一個有包膜的雙鏈DNA病毒，具有龐大的基因組，目前已知的編碼蛋白有84個，分為α、β、γ三類，基因表達的調(diào)控極為復雜，很多基因的功能以及調(diào)控過程仍不清楚。HSV-I在原發(fā)感染之后不能被宿主免疫系統(tǒng)徹底清除，會終生潛伏在宿主的神經(jīng)節(jié)細胞內(nèi)，一定狀態(tài)下被重新激活，對機體造成損傷。目前的研究結果仍不

3、能很好地解釋這種特殊的感染．潛伏．再激活的感染過程。 本課題的目的是預測并驗證HSV-I基因組中新的microRNA，進而研究它在HSV-I基因表達調(diào)控中的作用。利用生物信息學的方法，依據(jù)一定的條件，我們確定了HSV-I基因組中可能編碼microRNA的27個莖環(huán)結構，其中有4個在mieroRNA序列比對和預測軟件miRBase：：Sequences中顯示出較高的得分且在Herpes病毒家族中較為保守。提取HSV-I感染的細胞s