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文檔簡(jiǎn)介
1、聚酮類抗生素是由鏈霉菌生產(chǎn)的自然界中很重要的一類抗生素。在它的合成和釋放的過程中,硫酯酶發(fā)揮著重要的作用。它不僅能夠有效的催化抗生素產(chǎn)物的水解,同時(shí)還能夠校正抗生素碳鏈延伸中發(fā)生的錯(cuò)誤,確??股氐漠a(chǎn)量。本文針對(duì)從NCBI數(shù)據(jù)庫中搜索到的鏈霉菌中的硫酯酶氨基酸序列,利用鄰接法和最大似然法對(duì)TE進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析,建立了鏈霉菌硫酯酶的進(jìn)化發(fā)育樹,結(jié)果表明,鏈霉菌硫酯酶從氨基酸序列上可以分為三大類。另外,從構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中發(fā)現(xiàn),鏈霉菌中存
2、在一種acyl-CoATEⅡ,該類酶僅存在于五種鏈霉菌中。經(jīng)過多種序列分析手段和結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),這些acyl-CoATE Ⅱ同真核生物TesB家族的acyl-CoA TE Ⅱ在序列和拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)上都具有很高的保守性,并且在催化活性位點(diǎn)上完全保守。因此推測(cè)它們屬于TesB家族,并根據(jù)它們?cè)赑KS基因簇中的位置推測(cè)其功能為校正酶。 通過:PDB結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中不同pH值條件下苦霉素合成基因簇(PICS)TE和紅霉素合成基因簇(DEBS)TE的
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