廣西高致病性豬繁殖與呼吸綜合征的流行病學調(diào)查及其病毒ORF5、ORF6、ORF7基因的克隆與序列分析.pdf

1、廣西大學碩士學位論文廣西高致病性豬繁殖與呼吸綜合征的流行病學調(diào)查及其病毒ORF5、ORF6、ORF7基因的克隆與序列分析姓名：劉芳申請學位級別：碩士專業(yè)：傳染病與分子免疫學指導教師：陸芹章200806039 3 ．卜9 6 ．6 ％、8 8 ．7 —9 7 ．6 ％。從E 蛋白的變異來看，本次獲得的毒株與時間間隔最長的亞群I 的2 0 0 2 年廣西分離株G X A 核苷酸同源性為8 8 ．4 - 8 9 ．6 ％，氨基酸同源性為8 6

2、 ．卜8 7 ．6 ％；與亞群I I 的G ×W ×毒株的核苷酸和氨基酸同源性分另I J 為8 9 ．1 —9 0 ．5 ％年Ⅱ8 8 ．6 —9 0 ．5 ％，但與J X A l 、H U B 2 、H E B l 、H u N 株的核苷酸和氨基酸的同源性很高，分別高達9 8 ．5 —9 9 ．7 ％、9 7 ．5 —9 9 ．5 ％。這說明廣西2 0 0 6 年后流行的P R R S V 較以前的毒株有了較大程度

3、的變異，并與高致病性的J X A l 、H U B 2 、H E B l 、H u N 株的同源性非常高。與國內(nèi)外的P R R S 毒株比較，在推導編碼的氨基酸序列中，本研究的1 8 個毒株的E 蛋白氨基酸的變異主要集中在2 4 —3 9 a a 、5 8 —6 6 a a 、9 2 —1 0 4 a a 、1 6 卜1 6 4 a a 、1 8 5 —2 0 0 a a ；M蛋白的氨基酸變異主要發(fā)生在1 0 a a ，6 3 —7 0

4、 a a ，N 蛋白的氨基酸變異主要集中在4 6 a a 、9 1 a a 、1 0 9 a a 及1 1 7 a a 位點。k通過遺傳進化樹分析，1 8 個廣西P R R S 流行毒株與C H 一1 a 株同屬于亞群、． I I ，并與國內(nèi)流行的高致病性P R R S 變異毒株J X A l 、H U B 2 、、H E B l 、H u N 株親緣關系較近，同處于一個小分支，可能來源于同一個毒株。關鍵詞：高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病