三種跨膜蛋白預(yù)測算法的實現(xiàn)及比較.pdf

1、跨膜蛋白的預(yù)測算法是指一個專門用于預(yù)測一條蛋白質(zhì)序列中跨膜片段的數(shù)量的算法。根據(jù)對跨膜蛋白跨膜區(qū)的大量數(shù)據(jù)分析，特別是跨膜蛋白的拓撲學(xué)結(jié)構(gòu)上的大量分析，找出了運用生物信息學(xué)解決膜蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測問題的關(guān)鍵所在，再運用這些分析結(jié)果寫出針對不同蛋白質(zhì)(疏水性，水容性等)的跨膜區(qū)的預(yù)測算法。并且把這些預(yù)測算法以軟件形式實現(xiàn)，方便查詢。如給出一個未知跨膜片段的蛋白質(zhì)序列，把這個蛋白質(zhì)序列輸入到用預(yù)測算法做出的軟件中，得到下面的這些結(jié)果：這條蛋白質(zhì)序

2、列有幾個跨膜片段，每個跨膜片段的起止位置和一些相關(guān)系數(shù)。 隨著社會的發(fā)展和科學(xué)的進步，計算機在各個傳統(tǒng)學(xué)術(shù)領(lǐng)域得到了空前的運用，各種相關(guān)軟件的開發(fā)掀起了一股熱潮。而本片論文所討論的跨膜蛋白的預(yù)測算法正是用MATLAB語言來開發(fā)編寫的，旨在為廣大的科學(xué)工作者提供一個更便捷、規(guī)范、易于操作的蛋白質(zhì)領(lǐng)域跨膜區(qū)預(yù)測的查詢工具。因此無論科研還是應(yīng)用，都具有很重要的意義。 特別是在四川大學(xué)化學(xué)信息中心正在建立基于集群服務(wù)器和Web的

3、化學(xué)遠程計算平臺的背景下，將跨膜蛋白的預(yù)測算法架構(gòu)于該平臺上，讓用戶通過遠程訪問的方式進行對蛋白質(zhì)序列跨膜區(qū)數(shù)量的預(yù)測，由于平臺的共享和開放的，用戶可以通過Web方便的訪問。 綜上所述本文主要研究成果如下： 1.通過對相關(guān)知識的學(xué)習(xí)，分析了跨膜蛋白預(yù)測算法在現(xiàn)今的重要意義。 2.通過查閱預(yù)測算法的文獻，重新構(gòu)建了三種經(jīng)典的預(yù)測算法。并具體的分析了這三種預(yù)測算法的實現(xiàn)步驟和測試結(jié)果及其討論。 3.通過MAT