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1、肽抗生素(peptideantibiotics)是近年來發(fā)現(xiàn)的生物體基因編碼的具有抗微生物活性的小肽,通常是由12~60個(gè)氨基酸所組成,分子量<10kDa,是生物體天然免疫的重要組成部分。它作為一種新型的抗感染制劑,具有廣譜、高效的殺菌活性,在傳統(tǒng)抗生素耐藥性問題日益嚴(yán)重的今天,已成為抗生素研發(fā)中的一個(gè)重要熱點(diǎn)之一。 在過去五年,圍繞肽抗生素hPAB-β的研發(fā)工作中,我們已經(jīng)基本形成了一條完整的生產(chǎn)工藝路線。肽抗生素hPAB-β
2、是用簡(jiǎn)并引物從人皮膚角質(zhì)形成細(xì)胞中克隆到的一人β型肽抗生素。在獲得其堿基和氨基酸編碼序列后,通過化學(xué)合成并復(fù)性,證實(shí)了其抗菌活性。然后根據(jù)其特性,我們?cè)O(shè)計(jì)并篩選到了一個(gè)承載分子PaP3.30(16.7kDa),利用該分子能使hPAB-β融合蛋白在大腸埃希菌中的表達(dá)量達(dá)到菌體總蛋白的40%。然而,由于目標(biāo)蛋白hPAB-β(4.3kDa)在整個(gè)融合蛋白分子(23.6kDa)中只占約1/6,其實(shí)際表達(dá)量占菌體總蛋白的比率(表達(dá)率)僅約7%,產(chǎn)
3、量依然低下。為此,我們改用同尾酶法設(shè)計(jì)并構(gòu)建了hPAB-β多拷貝串聯(lián)體,并從得到的串聯(lián)體基因工程菌中篩選出3拷貝最佳工程菌phPAB-β(3)/JM109,對(duì)其發(fā)酵條件進(jìn)行了初步優(yōu)化,并對(duì)表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行純化,確定了肽抗生素hPAB-β制備的工藝路線:工程菌發(fā)酵→高壓勻漿破壁→包涵體提取→包涵體溶解→親和層析純化→羥胺裂解→反相層析純化→復(fù)性→分子篩層析純化→活性產(chǎn)物,最終得到了具有抗菌活性的目標(biāo)肽抗生素hPAB-β。 在上述制備工
4、藝路線中,仍然存在一些問題,需要進(jìn)一步優(yōu)化和完善:①發(fā)酵工程菌phPAB-β(3)/JM109發(fā)酵后的細(xì)菌濕重最高只有39.2g/L,與理想的高密度發(fā)酵有一定差距。②在羥胺裂解反應(yīng)中,存在著不同批次裂解產(chǎn)物的產(chǎn)量不穩(wěn)定現(xiàn)象,需要優(yōu)化,以實(shí)現(xiàn)目標(biāo)蛋白產(chǎn)量最大化。此外,所制備的目的肽抗生素的抗菌活性如何?抗菌譜廣否?有沒有細(xì)胞毒作用?等等,也是我們所關(guān)心的。為此,我們開展了本課題的研究,主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下: 1.hPAB-β3拷
5、貝串聯(lián)體基因工程菌的重新構(gòu)建:通過將重組質(zhì)粒pQE31-hPAB-β(3)轉(zhuǎn)化入攜帶有pREP4質(zhì)粒的感受態(tài)大腸埃希菌M15中,獲得了工程菌phPAB-β(3)/M15。工程菌的遺傳穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)表明,在AMP和KAN雙重選擇壓力下,新建工程菌的重組質(zhì)粒保存率仍為100%。進(jìn)一步通過14%SDS-PAGE蛋白電泳,篩選出目標(biāo)融合蛋白的高表達(dá)菌株,將之與以前的發(fā)酵工程菌phPAB-β(3)/JM109進(jìn)行了發(fā)酵對(duì)比研究。在1升搖瓶、3.7升和
6、10升發(fā)酵罐中的發(fā)酵結(jié)果顯示phPAB-β(3)/JM109發(fā)酵產(chǎn)量(g/L)分別為7.483+0.562,14.879±0.533,36.886±2.098,目標(biāo)蛋白表達(dá)率(%)分別為30.64±4.79,29.02±2.35,29.4±1.71;而phPAB-β(3)/M15的發(fā)酵產(chǎn)量(g/L)分別為9.265±0.241,24.25±1.466,53.213±2.577,目標(biāo)蛋白表達(dá)率(%)分別為32.3±2.51,29.58±4
7、.29,30.2±1.07。其中,在3種發(fā)酵規(guī)模下的細(xì)菌濕重,分別經(jīng)過t檢驗(yàn),表明兩者間有非常顯著的差異(P<0.01),而目標(biāo)蛋白表達(dá)率經(jīng)過t檢驗(yàn),表明兩者無顯著性差異。由此可見,新構(gòu)建的工程菌phPAB-β(3)/M15在3種發(fā)酵放大的規(guī)模中,發(fā)酵的濕菌產(chǎn)量都明顯優(yōu)于原工程菌phPAB-β(3)/JM109。隨后又通過15%Tricine-SDS-PAGE蛋白電泳,對(duì)phPAB-β(3)/M15目標(biāo)蛋白的表達(dá)形式和親和層析的效果進(jìn)行
8、鑒定,提示:新構(gòu)建工程菌中目的蛋白仍然采用包涵體形式表達(dá),且親和層析分離效果良好。因此,在生物工程技術(shù)的上游,通過構(gòu)建新的工程菌phPAB-β(3)/M15,在相似的目標(biāo)蛋白表達(dá)率情況下,發(fā)酵的濕菌量顯著增加,降低了目的分子制備的成本。表明它是更理想的,適合于發(fā)酵生產(chǎn)的基因工程菌。 2.hPAB-β3拷貝融合蛋白羥胺裂解反應(yīng)條件的優(yōu)化:首先,通過BCA法對(duì)親和層析分離的3拷貝融合蛋白進(jìn)行蛋白定量(15mg/m1)。然后,用8M尿
9、素將該融合蛋白稀釋五倍后,在45℃,pH9.0,2M鹽酸羥胺的裂解條件下,分別裂解反應(yīng)2、4.5、8小時(shí);另外,采用8M尿素將該融合蛋白分別稀釋2、5、8、10、20倍后,在45℃,pH9.0,2M鹽酸羥胺的裂解條件下,裂解反應(yīng)4.5小時(shí)。最后以反相層析的蛋白分離效果,作為3拷貝融合蛋白羥胺裂解效果的判定依據(jù),得出羥胺裂解反應(yīng)中被裂解的hPAB-β3拷貝融合蛋白最佳的濃度為1.875mg/L,最佳反應(yīng)時(shí)間為4.5hr。這樣,在生物工程技
10、術(shù)的下游,對(duì)融合蛋白羥胺裂解反應(yīng)的條件,進(jìn)行了完善和優(yōu)化。 3.肽抗生素hPAB-β體外抗菌活性的測(cè)定:首先,采用瓊脂擴(kuò)散法粗測(cè)了新制備的肽抗生素hPAB-β的抗菌活性,證實(shí)了它除具有抗細(xì)菌作用外,還有抗真菌活性。其次,測(cè)定了肽抗生素hPAB-β對(duì)129個(gè)來自不同種類的臨床分離株的最小抑菌濃度(MIC)和最小殺菌濃度(MBC),并以氨芐青霉素(AMP)作對(duì)照實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示肽抗生素hPAB-β對(duì)這129個(gè)臨床分離株的MIC為31.
11、25~250μg/ml,MBC為125~250μg/ml,而AMP對(duì)這些菌株的MIC基本>1mg/ml,呈耐藥性表現(xiàn),證實(shí)了肽抗生素hPAB-β廣譜而高效的抗菌活性。最后,又以金黃色葡萄球菌的標(biāo)準(zhǔn)菌株(ATCC25923)作為肽抗生素hPAB-β測(cè)試對(duì)象,并以臨床常用于治療革蘭陽性菌感染的克林霉素、新青Ⅱ和去甲萬古霉素作為對(duì)照實(shí)驗(yàn)組,描繪了相應(yīng)的生長(zhǎng)抑制曲線,表明hPAB-β的抗菌活性呈劑量依賴性,且抗菌效力低于去甲萬古霉素,而強(qiáng)于新青
12、Ⅱ,克林霉素;在時(shí)效上,抑菌時(shí)間略短于新青Ⅱ、克林霉素,而長(zhǎng)于去甲萬古霉素。 4.肽抗生素hPAB-β對(duì)真核細(xì)胞的細(xì)胞毒作用:首先,分別采用0.25、0.5、1、2、5mg/ml濃度的肽抗生素hPAB-β對(duì)健康人及小鼠的2%紅細(xì)胞懸液進(jìn)行作用,并設(shè)空白對(duì)照,觀察肽抗生素hPAB-β對(duì)紅細(xì)胞的溶血活性。結(jié)果表明:在生理鹽水中,肽抗生素hPAB-β(≤5mg/ml)對(duì)小鼠及人的紅細(xì)胞均無溶血活性。其次,將10mg/ml肽抗生素hPA
13、B-β采用連續(xù)倍比稀釋至31.25μg/ml,利用倒置顯微鏡觀察了各濃度肽抗生素hPAB-β,作用于正常猴腎VERO細(xì)胞48小時(shí)前后的形態(tài)改變,并設(shè)磷酸鹽緩沖液(PBS)對(duì)照。結(jié)果顯示:肽抗生素hPAB-β(≥625μg/m1)作用后的細(xì)胞,生長(zhǎng)狀況不良,甚至與死亡的細(xì)胞在相差顯微鏡下表現(xiàn)相同,提示肽抗生素hPAB-β對(duì)VERO細(xì)胞有細(xì)胞毒作用。最后,通過MTT細(xì)胞活力實(shí)驗(yàn),測(cè)定了肽抗生素hPAB-β對(duì)人肝癌細(xì)胞HepG2、猴腎VERO
14、細(xì)胞、人血管內(nèi)皮ECV304細(xì)胞的半數(shù)抑制濃度(IC50)分別為288.636、319.595、280.681μg/ml。經(jīng)t檢驗(yàn),表明三者無顯著性差異,且根據(jù)抗腫瘤藥物篩選標(biāo)準(zhǔn)(當(dāng)IC50>30μg/ml時(shí),對(duì)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)無明顯抑制作用),可以認(rèn)為肽抗生素hPAB-β對(duì)正常細(xì)胞VERO、ECV304和肝癌細(xì)胞HepG2都具有一定的非選擇性的細(xì)胞毒作用,但是對(duì)人肝癌細(xì)胞HepG2不具有抗腫瘤活性。 綜上所述,本研究成功構(gòu)建了新的
15、基因工程菌phPAB-β(3)/M15,發(fā)酵濕菌產(chǎn)量平均達(dá)到了53.213g/L,確定了3拷貝融合蛋白羥胺裂解的最佳濃度1.875mg/ml和最佳裂解時(shí)間4.5小時(shí),實(shí)現(xiàn)了肽抗生素hPAB-β制備工藝的進(jìn)一步優(yōu)化。同時(shí),肽抗生素hPAB-β對(duì)標(biāo)準(zhǔn)菌株和129個(gè)臨床分離菌株的MIC和MBC測(cè)定結(jié)果,顯示出了其與傳統(tǒng)抗生素相比,廣譜而高效的抗菌活性。另外,通過肽抗生素hPAB-β對(duì)人和小鼠紅細(xì)胞、人肝癌細(xì)胞HepG2、猴腎VERO細(xì)胞以及人
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