8q24,ITGAG基因和SLC22A3基因上6個SNPs與寧夏人群前列腺癌的關(guān)聯(lián)性研究.pdf

1、第一部分
　　目的:探討6個單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphismsSNPs)位點rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)基因型及其構(gòu)建的單體型與中國北方寧夏人群前列腺癌(PCa)的相關(guān)性。并且研究各多態(tài)性位點與前列腺癌(PCa)臨床病理特征的相關(guān)性。

2、r>　　方法:采用病例-對照研究的方法,收集來自寧夏銀川附屬醫(yī)院泌尿外科前列腺癌患者123例,年齡范圍為46-92歲,平均年齡72.1±7.28;選擇年齡相匹配的健康體檢者136例作為對照組,年齡范圍為46-93歲,平均年齡70.4±7.6歲。應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-高分辨率熔解曲線(PCR-HRM)技術(shù),分析rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10

3、090154(C/T)和rs7837688(G/T)6個SNPs各等位基因型在病例對照組中分布,并應(yīng)用SHEsis軟件構(gòu)建單體型。利用χ2和OR(OddsRatio)檢驗分析各SNP及其單體型與寧夏漢族老年前列腺癌的相關(guān)性,并分析各位點的基因型分布與前列腺癌床病理特征的相關(guān)性。
　　結(jié)果:1.rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs10090154(C/T)和rs78376

4、88(G/T)5個SNPs病例組與對照組之間,各等位基因型頻率差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。rs12621278G等位基因在兩組中的分布頻率分別為21.1％和31.1%,G等位基因在病例組中的分布頻率明顯低于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=1.695,95%CI=1.077~2.669,P=0.022);rs9364554CT基因型在兩組中的分布頻率分別為52.6%和38.6%,CT基因型在病例組中的分布頻率明顯高于對照組,差異具

5、有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.549,95%CI=0.304~0.990,P=0.045);rs13252298GG基因型在兩組中的分布頻率分別為7.4%和18.7%,GG基因型在病例組中分布頻率明顯低于對照組,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=2.857,rs1325229895%CI=中1.106~7.382,P=0.026);rs10090154TT基因型在兩組中的分布頻率分別為7.1%和0.0%,TT基因型在病例組中的分布頻率明顯高于對照組,

6、差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001);rs7837688GT基因型在兩組中的分布頻率分別為33.6%和23.3%,GT基因型的分布頻率病例組明顯高于對照組,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.564,95%CI=0.322~0.987,P=0.044);rs7837688T等位基因在兩組中的分布頻率分別是22.5%和14.0%,T等位基因在病例組中分布頻率明顯高于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.557,95%CI=0.351~0.885,

7、P=0.013);rs1447295基因型和等位基因頻率在兩組中的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。2.rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)的基因型頻率在前列腺癌患者中在年齡、Gleason評分、PSA濃度、吸煙及飲酒分布均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。3.rs13252298(A/G)

8、、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)構(gòu)建的單體型中有6個單體型在人群中的頻率超過3%,其中TATT單體型在病例組和對照組中的頻率分別為4.7%和0.0%,分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=319.301,95%CI=19.624~5195.447,P=0.006);TACG單體型在病例組和對照組中的頻率分別為0.0%和3.5%,分布差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.013);CATT、CCC

9、G、CCCT和TCCG單體型在病例組和對照組中的頻率分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。
　　結(jié)論:1.rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)5個SNPs可能與寧夏漢族老年男性前列腺癌發(fā)病風(fēng)險具有相關(guān)性,rs1447295(A/C)與寧夏漢族老年男性前列腺癌發(fā)病風(fēng)險無相關(guān)性。2.rs12621278(G/A)、rs

10、9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)與寧夏漢族老年男性前列腺癌診斷年齡、Gleason評分、PSA濃度、吸煙及飲酒均無相關(guān)性。3.rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)構(gòu)建的單體型中TACG和TATT單體型可能是寧夏漢族男性前列腺癌的危險因素。

11、
　　第二部分
　　目的:探討XPA和XPDDNA修復(fù)基因單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphismsSNPs)rs1800975和rs13181及基因-基因互作與寧夏漢族男性不育的相關(guān)性。
　　方法:采用病例-對照研究方法,于2010年9月~2012年12月分別收集經(jīng)由寧夏醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院生殖檢驗科確診的男性不育患者353例,年齡22~40歲,平均年齡(32.1±4.3);健康且生育

12、史的對照組388例,年齡24~40歲,平均年齡(30.6±3.4)。病例和對照年齡相差5歲以內(nèi)進行群體匹配。所有對象均為久居寧夏地區(qū)的漢族。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(polymerasechainreaction–restricted
　　fragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)方法檢測各位點基因型,應(yīng)用SHEsis在線軟件構(gòu)建單體型,利用χ2和OR(OddsRatio)檢驗分析各SN

13、P寧夏漢族男性不育的相關(guān)性;并分析XPA基因rs1800975與XPD基因rs13181的交互作用與寧夏漢族男性不育的相關(guān)性。
　　結(jié)果:XPA基因rs1800975(A>G)AG基因型相比AA基因型的分布頻率在病例組和對照組中的分布無統(tǒng)計學(xué)意義(OR=1.073,95%CI=0.757~1.521,P=0.692),GG基因型相比AA基因型的分布頻率在病例組和對照組中的分布無統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.973,95%CI=0.640~

14、1.478,P=0.898)。A、G等位基因的分布頻率在兩組中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.990,95%CI=0.807~1.214,P=0.921)。XPD基因rs13181(T>G)GT基因型相比較TT基因型的分布頻率型在病例組和對照組中的分布無統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.886,95%CI=0.589~1.333,P=0.562),GG基因型相比較TT基因型的分布頻率型在病例組和對照組中的分布無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.067)。T、G等位