骨幾何學(xué)參數(shù)和四肢瘦體重的雙變量全基因組關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、骨骼和肌肉兩者聯(lián)系緊密，共同構(gòu)成肌肉骨骼系統(tǒng)的主體。骨幾何學(xué)是骨骼的重要參數(shù)并與相關(guān)疾病如骨質(zhì)疏松等密切相關(guān)，四肢瘦體重(ALM)則是肌肉的重要參數(shù)也與一些疾病如肌肉減少癥等息息相關(guān)。研究證明股骨頸骨幾何參數(shù)(FNGP)如：骨直徑(W)、截面面積(C S A)、皮質(zhì)厚度(C T)、曲率(B R)、截面系數(shù)(Z)與瘦體重具有很高的遺傳相關(guān)性，但目前對同時調(diào)控這兩種表型的SNP/基因還知之甚少。全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)已被證明是檢測多效

2、基因的有效手段，為了鑒定FNGP與ALM之間共同的調(diào)控SNP/基因，我們對一大樣本量的中國人群進(jìn)行了雙變量GWAS。
　　 本研究共有1627位無血緣關(guān)系的中國漢人參與，其中男性802位，女性825位。我們采用雙能X射線骨密度儀測量他們的ALM和股骨頸(FN)處的骨密度(BMD))與骨大小，然后由FN處的BMD和骨大小計算出FNGP。基因分型采用的是Affymetrix公司的人類基因組SNP6．0分型芯片，經(jīng)基因分型共測定了約9

3、0萬個SNP，其中的689368個被選擇用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)研究。本研究采用基于線性模型的雙變量回歸分析檢測某個SNP同時與兩個表型的關(guān)聯(lián)度，關(guān)聯(lián)程度位于前列的SNP進(jìn)一步在2286名白人中進(jìn)行重復(fù)驗證。
　　 經(jīng)分析，我們發(fā)現(xiàn)13個SNP可能同時與FNGP和ALM相關(guān)，其中位于HK2(己糖激酶2)基因上的rs681900和UMOD(尿調(diào)蛋白)基因上的rs11859916與兩個表型的雙變量關(guān)聯(lián)p值分別為：7.58×10-6(ALM-B

4、R)和2.93×10-6(ALM-W)。rs681900和rs11859916在白人中進(jìn)行重復(fù)驗證的結(jié)果也達(dá)到了0.05的顯著水平，相應(yīng)的p值分別為0.024和0.047，薈萃分析合并兩次研究的結(jié)果得到相應(yīng)的p值分別為3．05×10-6和2.31×10-6。除了統(tǒng)計方面的證據(jù)外，以前生物學(xué)功能方面的研究也表明HK2基因和UMOD基因可能是同時影響FNGP和ALM的多效基因。此外，我們還發(fā)現(xiàn)另一包含11個SNP的連鎖群也同時與FNGP和A