水稻RIL群體SSR標記遺傳圖譜構建和稻米鎘含量QTL的初定位.pdf

1、我國南方水稻種植區(qū)稻米鎘超標成為社會關注的熱點。研究表明不同水稻品種稻米鎘含量差異顯著，因此選育低鎘水稻品種是降低稻米鎘含量的有效途徑。但有關水稻調控鎘離子吸收和轉運分子機制研究還很不深入，利用分子標記輔助育種培育低鎘水稻品種的研究還沒有真正開展，因此探討水稻調控吸鎘和籽粒鎘積累的分子機制，建立培育低鎘水稻的分子標記，是目前低鎘水稻育種的重要研究方向。本研究利用日本晴與9311雜交重組自交系(Recombinant inbred lin

2、es，RIL)為材料，進行微衛(wèi)星標記(SSR)與水稻稻米鎘含量的連鎖和關聯分析，旨在為培育水稻稻米低鎘品種提供分子標記。其主要結果如下:
　　1、選用614對覆蓋水稻12條染色體的SSR標記，對日本晴和9311進行多態(tài)性檢測，發(fā)現有48.5％（278對）的標記在親本日本晴和9311間具有差異。最終篩選出了123個標記，構建了以日本晴與9311衍生的RIL群體為基礎的分子連鎖遺傳圖譜，覆蓋水稻的12條染色體，圖譜總遺傳距離達到242

3、4.01 cM，標記間平均距離為19.71cM。
　　2、檢測到3個與水稻稻米鎘含量有關的QTLs，分別位于第6號染色體的標記RM1370與RM4608之間，第7號染色體的標記F14與F21之間，以及第9號染色體的標記ST6062處。連鎖分析表明，稻米鎘含量是一個由多基因控制的數量性狀。
　　3、對7個水稻鎘相關基因進行克隆測序，找到了每個基因在日本晴和9311間的多個差異性位點，以及對應的堿基突變狀態(tài)和氨基酸突變狀態(tài)。并對

4、24個水稻RIL群體材料進行了以測序為基礎的基因分型。
　　4、從生物信息學角度直接分析了10個水稻鎘相關的基因在日本晴和9311間的多個差異性位點，據此設計了特異性引物，對96個水稻RIL群體材料進行了基因分型。并發(fā)現基因OsHMA3和OsNRAMP5與稻米鎘含量的相關性較高。
　　5、相關性分析檢測到13個與水稻稻米鎘含量緊密關聯的SSR標記，分布在第2、3、5、6、7、8、9、10號染色體上。其中，對水稻稻米鎘含量正效