水稻SSR分子圖譜的構(gòu)建和四種不同QTL作圖方法的比較.pdf

1、水稻是世界最重要的栽培糧食作物，養(yǎng)活了世界近一半的人口。水稻的大多數(shù)性狀如產(chǎn)量、品質(zhì)、抗逆性等多為數(shù)量性狀，因此對(duì)數(shù)量性狀基因位點(diǎn)(QTL)進(jìn)行鑒定在水稻遺傳育種上具有重要意義。遺傳圖譜和數(shù)量性狀的作圖方法是進(jìn)行QTL定位的基礎(chǔ)，因此遺傳圖譜的準(zhǔn)確性和采用哪種作圖方法進(jìn)行QTL定位則是影響定位位點(diǎn)準(zhǔn)確度的二個(gè)重要因素。　　本研究以培矮64S(縮寫(xiě)為PA64S)×日本晴(Nipponbare，以下簡(jiǎn)稱(chēng)NIPP)的F2群體為作圖群體，構(gòu)建

2、了一張水稻SSR連鎖圖，比較了該圖與Temnykh和日本晴序列圖的異同。應(yīng)用目前常用的區(qū)間作圖法(IM)、復(fù)合區(qū)間作圖法(CIM)、基于混合線性模型的復(fù)合區(qū)間作圖法(MCIM)和多重區(qū)間作圖法(MIM)對(duì)該群體株高性狀進(jìn)行了QTL作圖比較分析。其主要結(jié)果如下：　　1、以(培矮64s/日本晴)F2180個(gè)單株為作圖群體，選用515對(duì)SSR引物在培矮64s和日本晴間進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè)，有155對(duì)引物在雙親間表現(xiàn)明顯多態(tài)性，以此構(gòu)建了包含137

3、個(gè)SSR標(biāo)記的水稻連鎖遺傳圖譜，該圖譜覆蓋基因組2046.2cM，標(biāo)記間平均距離17.1cM?！　?、該圖譜包含有85個(gè)Temnykh等圖譜上的SSR標(biāo)記，其中有82個(gè)標(biāo)記被定位于相同的染色體上，絕大多數(shù)標(biāo)記在2張圖譜上的線性排列順序相同?！　?、絕大多數(shù)SSR標(biāo)記在遺傳圖譜和序列圖譜上的線性排列順序相同，其中第1、2、3、8染色體上的標(biāo)記線性排列順序與序列圖譜上的線性排列順序完全相同?！　?、應(yīng)用區(qū)間作圖法(IM)、復(fù)合區(qū)間作圖