三個水稻電子遺傳圖譜的構建和水稻品種指紋圖譜庫的初步研究.pdf

1、為了提高明恢86背景下突變體基因定位的效率，本研究利用均勻分布于水稻12條染色體上的1232對SSR引物(其中716對來自己報道的SSR引物，516對新開發(fā)SSR引物)對明恢86與93-11、02428和中花15的多態(tài)性進行PCR分析，并根據(jù)這些標記及其標記的遺傳距離(部分標記直接引用McCouch等報道的遺傳距離，另一部分新開發(fā)標記的遺傳距離是根據(jù)物理距離推算)，利用Mapdraw.evenmarker軟件[109]繪制了三張基于水稻

2、明恢86的高密度電子遺傳圖譜(有別于傳統(tǒng)以分析群體基因型和重組率而構建的遺傳圖譜，因此我們稱之電子遺傳圖譜)。其中明恢86/9311電子遺傳圖譜包含的位點281個、標記間平均距離為5.34cM，而明恢86/02428和明恢86/qp花15圖譜包含的位點多達473個和470個，標記間的平均距離僅為3.22cM和3.23cM。本文完成六條染色體(染色體4-9號)的明恢86/9311、明恢86/02428、明恢86/中花15圖譜的位點依次為1

3、33個、200個、214個，標記間平均距離為5.22 cM、3.53 cM、3.35 cM，這三張高密度的電子遺傳圖譜的構建為高通量初步定位明恢86背景下突變體基因創(chuàng)造了條件，同時也為另外3個水稻品種突變體基因的圖位克隆提供了方便。 同時，我們利用親緣關系比較有代表性12個水稻品種(包含電子遺傳圖譜的4個親本)對均勻分布于水稻染色體上的1232對SSR引物進行多態(tài)性分析，篩選出3套均勻分布于12條染色體上的總共72對核心引物(每