鵝IGF-Ⅰ基因部分序列克隆及變異與生長、屠宰性能的關(guān)聯(lián)性.pdf

1、胰島素樣生長因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)是一類廣泛存在于機(jī)體多種組織中的蛋白多肽，是動物體內(nèi)重要的調(diào)節(jié)因子之一。其主要的生理功能之一是介導(dǎo)生長素的促生長作用，調(diào)節(jié)動物生長。本研究以皖西白鵝和朗德鵝作研究素材，采用比較基因組學(xué)方法，以鼠、豬、雞等比較保守的基因區(qū)域，應(yīng)用Dnastar和primer Premier 5.0軟件，設(shè)計引物對鵝的：IGF-Ⅰ基因5’端非編碼區(qū)和外顯子4序列克隆測序，并進(jìn)行同源性分析。運(yùn)用SNP技術(shù)檢測克隆片段，通過不

2、同基因型間生長和屠宰性能的比較，探討了影響鵝生長性能的主要基因的基因型。 1.克隆了皖西白鵝和朗德鵝 IGF-Ⅰ基因5’端非編碼區(qū)序列和外顯子4序列(GenBank登錄號：EF382668；EF460850)。序列比較分析表明，皖西白鵝5’端非編碼區(qū)序列與朗德鵝完全相同，與家雞同源性為94％，與豬的同源性為 79％。鵝外顯子4與雞的同源性為82％。 2.PCR-SSCP檢測結(jié)果表明：IGF-Ⅰ基因5’端非編碼區(qū)序列在pr

3、o1、pro2共有四個SNP位點(diǎn)，分別是：A-26 T，A-215G，A-314 G，A-32T；外顯子4片段經(jīng)SSCP檢測不存在多態(tài)性。 3.應(yīng)用TFSEARCHveF1.3軟件對.IGF-Ⅰ基因5’調(diào)控區(qū)潛在的調(diào)控元件和蛋白結(jié)合因子預(yù)測發(fā)現(xiàn)：A-314 G，A-325T兩個位點(diǎn)的堿基變異導(dǎo)致蛋白轉(zhuǎn)錄結(jié)合因子發(fā)生改變，其中A-314G變異使5’調(diào)控區(qū)增加一個NⅢ-2結(jié)合位點(diǎn)與之結(jié)合；而A-325T堿基變異增加了Hb、GATA-

4、2、GATA-Ⅰ蛋白轉(zhuǎn)錄結(jié)合因子。 群體遺傳分析表明：皖西白鵝Prol引物檢測的兩個等位基因，頻率分別為0.82和0.18，AA、AB、BB，基因型頻率分別為0.69、0.26、0.05；Pro2引物檢測的兩個等位基因頻率分別為0.74和0.26，CC、CD、DD，基因型頻率分別為0.54、0.39、0.08；群體在兩位點(diǎn)均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。朗德鵝Pro1和Pr02引物檢測的等位基因頻率分別為0.16、0

5、.84和0.29、0.71；AB、BB和CD、DD，基因型頻率分別為0.33、0.67和0.65、0.35；經(jīng)?<'2>適合性檢驗(yàn)，朗德鵝群體在兩位點(diǎn)均處于Hardy-Weiaberg 不平衡狀態(tài)。 對皖西白鵝的生長與屠宰性狀與其IGF-Ⅰ基因5’側(cè)翼調(diào)控區(qū)的多態(tài)性位點(diǎn)關(guān)聯(lián)分析表明：CC基因型6、8周齡體重、半凈膛重、胸肌重與DD基因型的差異顯著(P<0.05)，CC基因型的肝重與DD基因型的差異極顯著(P<0.01)，因此，可