黃顙魚生長激素基因多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)性研究.pdf

1、本研究對黃顙魚生長激素基因全長進行克隆測序，分析GH在組織中的差異性表達，對GH基因的單核苷酸多態(tài)性（SNP）和微衛(wèi)星（SSR）多態(tài)性與主要的生長性狀進行關(guān)聯(lián)分析，并獲得調(diào)控經(jīng)濟性狀的優(yōu)勢基因位點。
　?。?）GH基因的分子特征
　　根據(jù)親緣關(guān)系較近物種的GH基因的保守區(qū)域設計引物，通過克隆測序拼接后獲得DNA全長序列，共3117bp，包括5′UTR165bp，3′UTR485bp，由5個外顯子和4個內(nèi)含子組成，外顯子大小分

2、別為10bp、140bp、117bp、132bp、204bp，內(nèi)含子大小分別為302bp、85bp、642bp、835bp。
　?。?）GH基因的差異性表達
　　通過半熒光定量和實時熒光定量兩種方法研究黃顙魚GH基因mRNA的差異性表達。結(jié)果顯示：GH基因只在垂體中特異表達，而在肌肉、脾臟、脂肪、腎臟、胃、盲腸、心臟、頭腎、精巢、腸、鰓、肝臟、魚皮和腦這14個組織中均未檢測到表達。
　?。?）SNP與生長性狀的關(guān)聯(lián)性<

3、br>　　以GH基因作為影響黃顙魚主要生長性狀的候選基因，樣本數(shù)為160，通過PCR產(chǎn)物直接測序法篩選SNP位點，篩選區(qū)域為片段外顯子4到片段外顯子5和3′UTR區(qū)域，共檢測到5個SNP位點，內(nèi)含子4區(qū)域檢測到4個，3′UTR發(fā)現(xiàn)1個。并對SNP位點基因型和主要生長性狀（體重、全長、體長、體高、體厚、頭長、尾柄長、尾柄高）進行關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果顯示：存在于內(nèi)含子4的位點1674G>A和位點2154T>G與生長性狀無顯著關(guān)聯(lián)；位點2100A>

4、G與性狀體厚有極顯著關(guān)聯(lián)（P＜0.01），GG為優(yōu)勢基因型；位點2285T>C與尾柄長有顯著關(guān)聯(lián)（P＜0.05），CC為優(yōu)勢基因型；存在于3′UTR的位點2822A>G與全長、尾柄高有顯著關(guān)聯(lián)（P＜0.05），與體長、尾柄長有極顯著關(guān)聯(lián)（P＜0.01），GG為優(yōu)勢基因型。
　?。?）SSR與生長性狀的關(guān)聯(lián)性
　　通過SSRHunter軟件在黃顙魚GH基因上查找到4個微衛(wèi)星位點，將其在96-毛細管ABI3730xl上進行檢測，