建鯉FABPs基因克隆及jlFABP2a多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、脂肪酸結(jié)合蛋白(fatty acid binding proteins，F(xiàn)ABPs)是一組重要的細(xì)胞內(nèi)脂肪酸載體蛋白，存在于脊椎動物和非脊椎動物的多種組織細(xì)胞的胞漿中，對細(xì)胞內(nèi)長鏈脂肪酸的攝取、轉(zhuǎn)運(yùn)及代謝調(diào)節(jié)發(fā)揮著重要作用。本試驗(yàn)從建鯉(Cyprinus carpio var.jian)基因組分離了六條FABPs基因序列，通過序列結(jié)構(gòu)、同源性分析表明，所得序列分別屬于 FABP1、ABP2、FABP7，記為jlFABP1b1、jlFAB

2、P1b2、jlFABP2a、jiFABP2b、jlFABP7a1、jlFABP7a2。這些基因均由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子組成，內(nèi)含子序列和長度差異明顯，和對應(yīng)的斑馬魚氨基酸序列比較，相似度為81-90％。FABPs氨基酸系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示FABPs家族的基因是由一個(gè)共同的祖先iLBP基因分化而來，所有FABPs氨基酸序列分為三大簇，F(xiàn)ABP3和FABP7以很高的置信度聚在一起后與FABP11合為一支再與FABP4、FABP5、FABP8、F

3、ABP9、FABP12所在的一支合并，成為一大簇;FABP1、FABP6、FABP10也以很高的置信度合為另一大簇;FABP2單獨(dú)一簇。不同綱動物的FABPs間的遺傳距離和分類地位一致，很好地顯示了魚綱、兩棲綱、鳥綱和哺乳綱，但在目和科水平則不能確定地顯示物種分類地位之間的關(guān)系。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR測定了FABP2s、FABP7s和FABP3s基因分別在雌、雄建鯉的腦、肝胰臟、小腸、肌肉、腎、心臟、性腺的mRNA表達(dá)量，結(jié)果FABP2

4、s在雌魚和雄魚小腸中的表達(dá)量都極顯著最高于其它組織，且小腸中jlFABP2a表達(dá)量極顯著高于jlFABP2b。jlFABP3a主要在性腺、肝臟、腦、肌肉中表達(dá)，在精巢中的表達(dá)量極顯著高于其它組織;jlFABP3b在心臟、肌肉、肝臟中的表達(dá)量最大，顯著高于jlFABP3a，雄魚組織的表達(dá)量明顯高于雌魚。jlFABP7s主要在腦、肝臟和精巢中表達(dá)，各組織中，jiFABP7a2的表達(dá)量均高于jiFABP7a1，肝臟中jlFABP7a1幾乎不表

5、達(dá);除性腺外，jlFABP7s在其它組織中的表達(dá)量雌、雄魚間差異不大。
　　 比對8尾建鯉的jlFABP2a、2b基因序列，結(jié)果在jlFABP2a和2b上分別找到12個(gè)和4個(gè)SNP，均位于內(nèi)含子上。使用PCR-RFLP法檢測了jlFABP2a上4個(gè)SNP位點(diǎn)I1-A15G、I1-A99G、I2-C487T和I3-A27T在建鯉選育群體中的基因型分布，并進(jìn)行了基因型與個(gè)體增重的關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果4個(gè)位點(diǎn)與雌、雄成魚階段增重分別有極顯著