MC4R基因多態(tài)性及其與湖羊早期生長性狀的相關(guān)研究.pdf

1、本研究通過對湖羊早期生長發(fā)育規(guī)律的研究、同時將MC4R基因作為影響湖羊生長性狀的候選基因，利用生物信息學(xué)方法，克隆了湖羊黑素皮質(zhì)素受體-4（melanocortin-4receptor, MC4R）的DNA序列，在群體范圍內(nèi)進行了PCR-SSCP分析，并對湖羊MC4R單核苷酸多態(tài)性及其與早期生長性狀之間進行關(guān)聯(lián)分析，篩查與肉用湖羊的早期生長性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，為肉用湖羊的分子標(biāo)記輔助育種提供理論基礎(chǔ)。
　　 一、湖羊早期生長曲線

2、的擬合
　　 本試驗采用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy三種常用的生長曲線模型對湖羊的早期生長進行擬合，結(jié)果以Von Bertalanffy模型對湖羊早期生長發(fā)育的擬合效果最好。根據(jù)此模型可建立湖羊的早期階段的生長曲線，為其早期選育和改善飼養(yǎng)管理提供了依據(jù)。
　　 二、湖羊MC4R基因的克隆及其生物信息學(xué)分析
　　 本試驗克隆得到湖羊MC4R基因全序列，全長1765bp，包括21

3、3bp的5,-UTR,999bp的開放閱讀框和553bp的3’-UTR，編碼332個氨基酸殘基，分子量為36.57KDa,等電點為7.09，具有和其他哺乳動物相同的7次跨膜結(jié)構(gòu)域。該蛋白具有較高的保守性，湖羊與牛的MC4R蛋白同源性最高，為95.78％;順次為犬(91.87％)，與人和恒河猴(91.57％)、大鼠(90.96％)和小鼠(90.36％)。試驗推定的湖羊MC4R蛋白存在多個功能位點或功能基序，與目前研究獲得的MC4R的生物學(xué)

4、功能是一致的。三、湖羊MC4RPCR-SSCP檢測及其多態(tài)與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
　　 試驗采用PCR-SSCP的方法對所克隆的湖羊MC4R基因的全序列進行了SNPs檢測。試驗設(shè)計的8對引物中，在M6和M7兩對引物擴增序列中檢測到了多態(tài)性，并均表現(xiàn)為3種基因型。湖羊群體中SNPM6以等位基因B為主，等位基因頻率達到0.7361,A等位基因頻率僅為0.2639。SNPM7以等位基因C為主，等位基因頻率達到0.7292,D等位基因頻率

5、為0.2708。x2適合性檢驗結(jié)果表明，湖羊群體在SNPM6處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(p＞0.05),SNPM7則處于非平衡狀態(tài)(p＜0.05).SNPM6和SNPM7的多態(tài)信息含量分別為0.313和0.3169，屬中度多態(tài)，說明MC4R SNPM6和SNPM7基因標(biāo)記的遺傳變異較大，可望獲得更多的選擇效果。
　　 不同基因型的初生重、斷奶重的最小二乘均值及標(biāo)準(zhǔn)誤結(jié)果表明：SNPM6 AA型的斷奶重極顯著的高于B

6、B型和AB型(p＜0.01)，SNPM7DD型斷奶重也極顯著高于CC型和CD型(p＜0.01)。另外，DD型初生重極顯著高于CC型(p＜0.01)，顯著高于CD型(p＜0.05)。
　　 SNPM6A等位基因和SNPM7D等位基因?qū)τ诤虻某跎?、斷奶重具有正效?yīng)；而B等位基因和C等位基因?qū)τ诤虻某跎?、斷奶重具有?fù)效應(yīng)。同時相關(guān)分析結(jié)果表明SNPM6、SNPM7與湖羊斷奶重均極顯著相關(guān)。這表明MC4R可以作為與湖羊生長性狀相