雞IGF-Ⅰ基因PCR-SSCP分析及其與肉用性狀關(guān)系的研究.pdf

1、胰島素樣生長因子-I(IGF-1)是動(dòng)物體內(nèi)重要的調(diào)節(jié)因子之一，因此，研究雞的IGF-1基因多態(tài)性與其重要經(jīng)濟(jì)性狀間的關(guān)系，使得IGF-1基因越來越受到重視，并被作為一個(gè)重要的候選基因進(jìn)行研究。目前，對(duì)IGF-1多態(tài)性的研究主要是采用PCR-RFLP技術(shù)，由于酶切技術(shù)可能會(huì)存在有些序列不能被限制性內(nèi)切酶所識(shí)別，而導(dǎo)致其檢測(cè)受到限制。相反，PCR-SSCP技術(shù)能夠更加靈活的應(yīng)用于SNPs的檢測(cè)、篩選。本實(shí)驗(yàn)對(duì)新?lián)P州雞(130只)、雪山雞(

2、100只)和萊航雞(47只)的IGF-1基因進(jìn)行了PCR-SSCP多態(tài)性檢測(cè)；并結(jié)合測(cè)序驗(yàn)證。對(duì)設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行了PCR擴(kuò)增和電泳檢測(cè)最優(yōu)條件的探索，建立和完善了特定位點(diǎn)的PCR-SSCP檢測(cè)方法。建立統(tǒng)計(jì)分析模型，應(yīng)用GLM過程對(duì)新?lián)P州雞部分生長和屠宰性狀進(jìn)行分析。本論文得到的結(jié)論如下： 1.本實(shí)驗(yàn)確立了檢測(cè)雞胰島素樣生長因子I(IGF-I)基因5'-UTR、Exon1和3'-UTR的最佳PCR-SSCP方法。并在新?lián)P州雞、雪山

3、雞和萊航雞共發(fā)現(xiàn)了四個(gè)多態(tài)位點(diǎn)；分別為：23F/R、26F/R、28F/R和29F/R。 2.對(duì)多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行基因型頻率和基因頻率以及基因型分布分析，其結(jié)果：新?lián)P州雞23F/R等位基因A頻率：0.8038，等位基因B頻率：0.1962;28F/R等位基因A頻率：0.3846，等位基因B頻率：0.6154。雪山雞等位基因頻率為：26F/RA：0.8200，B：0.1800;28F/RA：0.3819，B：0.6181；經(jīng)基因型分布卡

4、方檢驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)新?lián)P州雞上的兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)處于哈代-溫伯格平衡(P=0.929、P=0.966)，雪山雞不處于哈代-溫伯格平衡(P=0.002、P=0.112)，并發(fā)現(xiàn)多態(tài)位點(diǎn)存在品種分布差異。 3.對(duì)存在多態(tài)的4個(gè)座位PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序，測(cè)序結(jié)果顯示在IGF-I存在插入突變G(23F/R)和同義替換C→G(28F/R)；可能涉及T→C(26F/R)和C→A(29F/R)。 4.在早期體重方面，23F/R基因型中，二周齡體

5、重BB型與AB型差異顯著(P＜0.05)，但AA型與AB型和BB型均不顯著(P＞0.05)；在十二周齡，BB型對(duì)AA型型在龍骨長上，接近差異顯著水平(P=0.068)。而28F/R基因型中在十二周齡體重BB型與AA型接近差異顯著水平，P=0.055。綜合分析，兩個(gè)突變位點(diǎn)基因型中，BB型和AB型對(duì)新?lián)P州雞的增重和龍骨、脛骨生長趨勢(shì)優(yōu)于AA型；但就影響效應(yīng)分析，28F/R的影響較??；可將這兩個(gè)突變位點(diǎn)作為選育參考。 5.結(jié)合屠宰測(cè)