雞apoAV基因的多態(tài)及其與雞屠體性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、載脂蛋白AV基因(apolipoproteinAV，apoAV)是一個(gè)通過(guò)生物信息學(xué)比對(duì)而發(fā)現(xiàn)的新基因，在人、鼠中與血漿甘油三酯(TG)濃度有極大相關(guān)。本研究利用候選基因法，根據(jù)GenBank上預(yù)測(cè)的雞apoAV基因序列設(shè)計(jì)引物，利用PCR-SSCP篩選雞apoAV 5'-調(diào)控區(qū)、第一外顯子、第二內(nèi)含子和第二外顯子的多態(tài)，并與雞屠體性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果如下： (1)三對(duì)引物所擴(kuò)增的片段皆有多態(tài)性。用引物ApoAlL/R在5'

2、-調(diào)控區(qū)檢測(cè)到3種基因型，對(duì)純合型個(gè)體進(jìn)行回收測(cè)序后發(fā)現(xiàn)該片段-169位核苷酸發(fā)生突變，為C→T的轉(zhuǎn)換；用引物ApoA2L瓜在第一外顯子上沒有檢測(cè)到多態(tài)性，但發(fā)現(xiàn)在第二內(nèi)含子第29位核苷酸由T突變?yōu)镃；用引物ApoA3L/R檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)第二外顯子600位核苷酸由C突變?yōu)門，所編碼的氨基酸沒有發(fā)生變化，為同義突變；第635位核苷酸由T突變?yōu)镃，氨基酸由亮氨酸變?yōu)楦彼?，為錯(cuò)義突變。 (2)在中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)CAU資源群體(白洛克和絲羽烏

3、骨雞正反交F2代)中，ApoAlL/R擴(kuò)增片段多態(tài)性位點(diǎn)的基因型頻率分別為MM型0.59，MN型0.27，NN型0.14，等位基因頻率M為0.72，N為0.28；ApoA2L/R擴(kuò)增片段多態(tài)性位點(diǎn)基因型頻率分別為EE型0.17，EF型0.56，F(xiàn)F型0.28，E和F等位基因頻率分別為0.45和0.55；ApoA3L/R擴(kuò)增片段多態(tài)性位點(diǎn)基因型頻率分別為AA型0.48，AB型0.31，AC型0.09，BB型0.05，BC型0.04，CC型

4、0.03。A，B，C的等位基因頻率分別為0.68，0.23，0.09。經(jīng)卡方檢驗(yàn)，這三個(gè)位點(diǎn)均符合Hardy-Weinberg平衡。 (3)ADoAlL/R位點(diǎn)基因型對(duì)12周齡的屠體性狀沒有顯著影響。ApoA2L/R位點(diǎn)基因型對(duì)12周齡的肝重有顯著影響(P<0.05)：FF型的肝重顯著低于EE型和EF型肝重。ApoA3L/R位點(diǎn)基因型對(duì)腹脂重、肝重、心重有顯著影響：CC型的腹脂重、腹脂率顯著高于AA型、AB型、AC型、BC型的腹