豬P311基因PCR-SSCPs及其與肉質(zhì)性狀關系的研究.pdf

1、神經(jīng)蛋白3.1(neuronal protein3.1，P311)又稱PTZ17，由定位于豬2號染色體的P311基因負責編碼，由Studler等于1993年首次發(fā)現(xiàn)于小鼠胚胎的腦組織中。研究表明P311蛋白廣泛存在于多種組織細胞中，且是一種細胞內(nèi)蛋白質(zhì)，主要存在于胞漿中，在細胞核內(nèi)亦有少量定位。P311基因mRNA序列中包含三個開放閱讀框(open reading frame，ORF)，但僅第一個開放閱讀框負責編碼蛋白質(zhì)。本實驗室前期通

2、過抑制性消減雜交發(fā)現(xiàn)該基因在萊蕪豬及大白豬中的表達量差異顯著。本試驗主要通過PCR-SSCP方法鑒定了54頭萊蕪豬和40頭魯萊黑豬該基因第一內(nèi)含子及3'側翼區(qū)共5處多態(tài)位點，并對各基因型個體的表達水平及另外4個相關基因SPARC、MYL1、ACADM、ACSL的表達水平進行檢測。主要結果如下:
　　1、對94頭試驗豬的肉質(zhì)測定數(shù)據(jù)進行描述性統(tǒng)計分析及品種內(nèi)和總群體的肉質(zhì)數(shù)據(jù)間的相關性分析。萊蕪豬平均肌內(nèi)脂肪含量為8.96％，pH1

3、為6.54，pHμ為5.82，肉色評分為3.37，大理石紋評分為4.02，滴水損失為1.13％，失水率為19.91％，烹飪損失為17.60％，剪切值為36.02 N，魯萊黑豬上述肉質(zhì)性狀平均值分別為5.64％、6.44、5.64、3.04、3.31、2.88％、27.92％、26.22％、36.04 N。品種內(nèi)及總群體中均表現(xiàn)為IMF與pH1、大理石紋呈顯著的正相關關系而與肉色、嫩度的相關性不顯著，滴水損失、失水率、烹飪損失三者兩兩之間

4、均呈顯著相關。
　　2、5個多態(tài)位點SNP1F/1R位點、SNP2F/2R位點、SNP3F/3R位點、polyA1F/1R位點和polyA2F/2R位點中除SNP3F/3R位點僅檢測到兩種基因型以外，其余4個位點均檢測到三種基因型。5個位點處的各種基因型分別命名為SNP1F/1R位點處的AA型、BB型和AB型，SNP2F/2R位點處的CC型、DD型和CD型，SNP3F/3R位點處的EE型和EF型，polyA1F/1R位點處的MM型

5、、NN型和MN型，polyA2F/2R位點處的OO型、PP型和OP型。兩豬種在SNP2F/2R、SNP3 F/3R、polyA1F/1R位點處的優(yōu)勢等位基因相同，均為D、E、M基因。SNP2F/2R、polyA1F/1R和polyA2F/2R位點的多態(tài)分布在萊蕪豬和魯萊黑豬中均達到哈代-溫伯格平衡。
　　3、測序結果證明SNP1F/1R位點和SNP2F/2R位點的突變類型均為A/G突變，SNP3F/3R位點的突變類型為C/T突變，

6、上述三個突變位點分別為該基因的7636 bp、7976 bp、6207bp處。 polyA1F/1R和polyA2F/2R位點處的變異類型為缺失/插入突變，其中，polyA1F/1R位點處MM型和NN型的連續(xù)腺苷酸數(shù)目分別為18和15，polyA2F/2R位點處OO型和PP型的連續(xù)腺苷酸數(shù)目分別為15和12，MN型和OP型分別為兩polyA位點的雜合型。
　　4、萊蕪豬群體中SNP1F/1R多態(tài)位點處僅pHμ指標在3種基因型之間存

7、在差異顯著性，表現(xiàn)為AB型的pHμ顯著高于AA型和BB型，而魯萊黑豬群體內(nèi)僅在肉色、剪切值兩指標上檢測到差異顯著性，AA型的肉色顯著高于BB型，AA型的剪切值顯著高于AB型，其他情況下均差異不顯著。兩豬種中SNP2F/2R位點處3種基因型之間在9項肉質(zhì)指標處均不存在差異顯著性。SNP3F/3R點處萊蕪豬群體中以EF型個體肉質(zhì)較好，而魯萊黑豬群體中以EE型個體肉質(zhì)較好。兩豬種polyA1 F/1R多態(tài)位點處的3種基因型之間在9項肉質(zhì)性狀上

8、均未表現(xiàn)出差異顯著性，但均表現(xiàn)為MN型個體的肉質(zhì)性狀普遍優(yōu)于其他兩純合型。萊蕪豬polyA2F/2R多態(tài)位點處三種基因型的肉質(zhì)性狀無差異顯著性，而魯萊黑豬中3種基因型之間在失水率和烹飪損失指標上表現(xiàn)出差異顯著性，且PP型個體的失水率顯著高于OP型個體，OO型和PP型個體的烹飪損失顯著高于OP型。
　　5、萊蕪豬與魯萊黑豬群體內(nèi)SNP1F/1R位點處3種基因型個體的SPARC、MYL1、P311基因的表達水平差異均不顯著，ACADM

9、、ACSL兩基因的表達水平僅在萊蕪豬群體內(nèi)差異顯著，表現(xiàn)為BB型個體的表達水平顯著高于AA型和AB型，后兩者之間差異不顯著。兩豬種中SNP2F/2R位點處各基因型上述5個基因的表達量均差異不顯著。萊蕪豬群體內(nèi)SNP3F/3R位點處5個基因的表達水平均表現(xiàn)為EE＜EF，魯萊黑豬群體中除P311基因外其他4個基因也呈現(xiàn)這種趨勢。萊蕪豬群體中polyA1F/1R位點處5個基因的表達水平在3種基因型之間差異均不顯著，而在魯萊黑豬群體中MYL1基