版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡介
1、本文首先分析了多肽片段中央氨基酸的結(jié)構(gòu)。提出并運(yùn)用了C’偏離(C’deviation)這個(gè)概念來分析氨基酸的結(jié)構(gòu)變化。在結(jié)果顯示中運(yùn)用了分布直徑和散點(diǎn)圖來直觀地顯示原子分布的差異。在這部分實(shí)驗(yàn)中,通過對比三肽片段和五肽片段中央氨基酸的結(jié)構(gòu)分布的差異,發(fā)現(xiàn)隨著組成相同的多肽片段長度的增加,其中央氨基酸的結(jié)構(gòu)差異會變小。同時(shí),分析了三肽片段中央氨基酸在不同二級結(jié)構(gòu)條件下的分布情況,發(fā)現(xiàn)在螺旋或折疊狀態(tài)時(shí),其中央氨基酸的C’原子分布在不同的區(qū)
2、域。 根據(jù)多肽片段中央氨基酸的結(jié)構(gòu)分析的結(jié)果——隨著組成相同的多肽片段長度的增加其中央氨基酸的結(jié)構(gòu)差異會變小,建立了一種基于多肽片段中央氨基酸裝配的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測新方法。這種方法把目標(biāo)序列分割成九肽片段,并按序列順序逐個(gè)裝配九肽片段的中央氨基酸,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)模型的建立。因?yàn)樗阉鞯降呐c目標(biāo)片段最匹配的九肽片段中央氨基酸與目標(biāo)殘基時(shí)完全一致的,所以在結(jié)構(gòu)預(yù)測過程中避免了殘基替換的問題,同時(shí)側(cè)鏈的坐標(biāo)也可以經(jīng)過轉(zhuǎn)換后使用最佳匹配
3、片段中央氨基酸的坐標(biāo),又解決了側(cè)鏈安置問題。 最后,評估了這種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測新方法的精度和運(yùn)算效率。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示使用這種新方法預(yù)測蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的精度是比較高的。運(yùn)行時(shí)所需的計(jì)算資源較少,普通個(gè)人計(jì)算機(jī)就可以進(jìn)行。這種方法的可移植性還非常好,無論是Winows和Linux,只要安裝了Perl的編譯器,就可以直接運(yùn)行。計(jì)算過程中無需人工干預(yù),實(shí)現(xiàn)了真正的全自動(dòng)。 本研究的主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn): 1.首次提出并運(yùn)用了C’偏離(
4、C’deviation)來分析多肽片段中央氨基酸氨基酸的結(jié)構(gòu),C’偏離比角度方法更加直觀; 2.運(yùn)用了分布直徑來描述原子空間分布情況,可以直觀地比較原子分布范圍的大小; 3.分析了不同局部相似性狀態(tài)下多肽片段中央氨基酸結(jié)構(gòu)分布,發(fā)現(xiàn)局部相似性對多肽片段中央氨基酸結(jié)構(gòu)影響顯著; 4.分析了不同二級結(jié)構(gòu)狀態(tài)下多肽片段中央氨基酸結(jié)構(gòu)的分布,發(fā)現(xiàn)不同的二級結(jié)構(gòu)狀態(tài)下中央氨基酸結(jié)構(gòu)分布規(guī)律不同; 5.建立一種基于九
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 氨基酸、多肽與蛋白質(zhì)
- 氨基酸、多肽、蛋白質(zhì)和核酸
- 基于氨基酸序列的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能預(yù)測方法研究.pdf
- 氨基酸蛋白質(zhì)核酸
- 蛋白質(zhì)和氨基酸
- 氨基酸蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)纖維
- 蛋白質(zhì)氨基酸原創(chuàng)
- 基于氨基酸序列信息的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測研究.pdf
- 氨基酸、肽和蛋白質(zhì)
- 蛋白質(zhì)分解氨基酸代謝
- 氨基酸、蛋白質(zhì)、核酸備課
- 蛋白質(zhì)和氨基酸課件
- 構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸種類
- 蛋白質(zhì)與氨基酸的測定
- 蛋白質(zhì)降解與氨基酸代謝
- 蛋白質(zhì)化學(xué)總論和氨基酸
- 基于結(jié)構(gòu)信息和偽氨基酸組分信息預(yù)測抗凋亡蛋白質(zhì)與促凋亡蛋白質(zhì).pdf
- 蛋白質(zhì)分解及氨基酸代謝
- 輻射加工方式對食品中氨基酸、多肽、蛋白質(zhì)的影響
- 十一蛋白質(zhì)降解及氨基酸代謝
評論
0/150
提交評論