我國HIV感染者中整合素α4β7結(jié)合位點(diǎn)的分布.pdf

1、目的：HIV-1感染建立及病毒傳播的機(jī)制是HIV研究的前沿和熱點(diǎn),整合素α4β7能與gp120特異性結(jié)合并傳遞信號(hào),結(jié)合位點(diǎn)是V2環(huán)區(qū)的保守三肽,促進(jìn)病毒的感染、復(fù)制和傳播。在中國,性傳播和注射吸毒是主要的HIV感染者的傳播方式,性傳播排在首位并還有增長的趨勢。因此研究整合素α4β7結(jié)合位點(diǎn)在HIV感染者中的分布,以及整合素α4β7對(duì)性傳播人群的選擇具有重要的意義。
　　方法：本實(shí)驗(yàn)樣本選擇四川涼山的CRF07_BC的異性傳播和注

2、射吸毒兩組人群的陽性血漿樣本,用巢式PCR擴(kuò)增gp120的V1-V5區(qū),查看整合素α4β7結(jié)合位點(diǎn)在CRF07_BC中的分布,以及在異性傳播和注射吸毒人群中的分布差異,通過熵值和非同義突變與同義突變的比值(dN/dS)比較兩組人群的序列差異,查看整合素α4β7對(duì)性傳播人群通過V2區(qū)保守三肽的選擇。并通過鄰接法、最大似然法和貝葉斯方法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,查看序列的分類和進(jìn)化情況。
　　結(jié)果：實(shí)驗(yàn)結(jié)果得到206條序列,其中異性傳播人群10

3、3條序列,吸毒注射人群103條序列,在這兩組人群中有191條序列的整合素α4β7結(jié)合位點(diǎn)是LDI,占到總序列中的92.7％。在吸毒注射人群中三肽分布:93條LDI,5條LDV,2條LDM,1條PDI,1條VDV,1條LDL,香農(nóng)指數(shù)為0.45。在異性傳播人群中的分布為:98條LDI,1條LDV,1條LDM,1條PDI,1條TDI,1條VDI,香農(nóng)指數(shù)為0.27,IDU人群的香農(nóng)指數(shù)大于異性傳播人群,說明了IDU人群的α4β7結(jié)合位點(diǎn)多樣

4、性高。通過計(jì)算熵值,在群體水平靜脈吸毒人群有6個(gè)位點(diǎn)熵值高于異性傳播人群,異性傳播人群有11個(gè)位點(diǎn)高于靜脈吸毒人群。異性傳播人群比起靜脈吸毒人群的熵值要高,氨基酸變異度更大。在整合素結(jié)合位點(diǎn)(29,30,31)的三個(gè)氨基酸中,IDU人群的熵值在氨基酸31位點(diǎn)很高,兩組人群在該位點(diǎn)有顯著性差異,IDU人群在該位點(diǎn)變異度大,異性傳播人群在該位點(diǎn)變異度小,說明了異性傳播人群在該位點(diǎn)進(jìn)行了選擇。在選擇壓力作用下在靜脈吸毒人群中有7個(gè)顯著性差異陽

5、性選擇的位點(diǎn),有25個(gè)顯著性差異陰性選擇的位點(diǎn),異性傳播人群中有9個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了顯著性差異的陽性選擇,有58個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了顯著性差異陰性選擇。群體水平上異性傳播人群更多的位點(diǎn)上進(jìn)行選擇。異性傳播人群在整合素α4β7結(jié)合每個(gè)氨基酸的dN/dS要比靜脈注射人群要低,以靜脈注射人群為對(duì)照,異性傳播人群在30位點(diǎn)和31位點(diǎn)發(fā)生了選擇(P<0.05)。通過三種方式構(gòu)建進(jìn)化樹可以確定了分析數(shù)據(jù)都是CRF07_BC亞型,這些病人之間沒有相互傳播關(guān)系。