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文檔簡介
1、本研究選取了來自國內(nèi)外具有一定代表性的Soja亞屬和Glycine亞屬共16個種81份材料,通過利用實驗室前期的已測序數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫中的大豆重測序數(shù)據(jù),對野生大豆和栽培大豆中均未發(fā)現(xiàn)變異位點的基因進行篩選,以期挖掘出新的適用于大豆屬系統(tǒng)發(fā)育研究的核基因;同時結(jié)合文獻中挑選的基因序列信息,重構(gòu)大豆屬的系統(tǒng)發(fā)育樹,為后續(xù)對大豆屬進行近一步的研究奠定基礎。主要結(jié)果如下:
1、本文共挑選了14個基因片段,其中從文獻中挑選了4個cpDNA
2、片段,3個nDNA片段;從實驗室數(shù)據(jù)和重測序數(shù)據(jù)中,篩選出7個新的引物通性較高、變異速率適中(約10%)、易裝配的低拷貝的核基因片段。
2、4個cpDNA片段,測序長度共2068bp,SNP位點95個,θ值0.00925,π值0.01100;3個nDNA片段,測序長度共1074bp,SNP位點170個,θ值0.03188,π值0.03223;7個新的nDNA片段,測序長度共2567bp,SNP位點258個,θ值0.02024,
3、π值0.01705。
3、對大豆屬各種內(nèi)遺傳多樣性進行分析,不同物種的遺傳多樣性差異較大。其中G.can、G.cla、G.tab、G.tom四個種的π值和θ值相對較高,并且G.tab的π值和θ值明顯高出其它種,說明其種內(nèi)差異較大。
4、對大豆屬進行系統(tǒng)發(fā)育分析,大豆屬被分為黃豆亞屬和大豆亞屬兩個大支;大豆亞屬內(nèi)又被劃分為3個主要的分支。該研究結(jié)果在大支的劃分上與前人的研究結(jié)果相一致。單獨基于不同類型的基因數(shù)據(jù)進行建樹
4、分析,結(jié)果表明分別基于葉綠體基因與核基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹在Glycine亞屬內(nèi)的劃分明顯不同。
5、單獨基于葉綠體基因與核基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,G.tabacina均被劃分為兩組,一組是來自國內(nèi)的品種G.tab6-G.tab10(2n=80),一組是來自澳大利亞的品種G.tab1-G.tab5(2n=40)。推測可能是由于四倍體的G.tabacina(2n=80)是古多倍體復合體,與二倍體G.tabacina之間的遺傳差異較
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