鴨-魚混養(yǎng)場養(yǎng)殖環(huán)境抗菌藥物耐藥基因污染及微生物群落特征.pdf

1、在廣東乃至整個華南地區(qū)，由于水系發(fā)達(dá)，大部分地區(qū)是以鴨-魚混養(yǎng)模式為主。在養(yǎng)殖過程中，大量的抗菌藥物被用于促生長和防治疾病，導(dǎo)致動物源性致病菌的耐藥性越來越嚴(yán)重，這些攜帶有耐藥基因(ARGs)的細(xì)菌經(jīng)排泄物等途徑未經(jīng)處理就進(jìn)入環(huán)境土壤、地表、地下水體中，成為環(huán)境中抗生素耐藥基因的主要來源，而ARGs作為一種潛在的環(huán)境污染物，受到了人們的廣泛關(guān)注。
　　本論文選擇三個廣東地區(qū)典型的鴨魚混養(yǎng)型養(yǎng)殖場，按一年四個季度連續(xù)四次采集養(yǎng)殖場周

2、邊環(huán)境樣品（土壤、底泥、水），通過熒光定量的方法連續(xù)監(jiān)測其耐藥基因豐度；以及通過16S rDNA高通量測序的方法監(jiān)測微生物群落結(jié)構(gòu)的變化情況。監(jiān)測結(jié)果顯示，在所有樣品中磺胺類藥物耐藥基因的豐度較高，其中以sul1基因豐度最高，在土壤、底泥和水中的平均相對豐度分別達(dá)到8.15×10-1、3.12×10-1和2.31×10-1 copies/16S rDNA copies，高于之前文獻(xiàn)報告的豐度，環(huán)境中耐藥基因污染嚴(yán)重；結(jié)合各類基因豐度大小

3、及其相關(guān)性分析，初步確定了每類藥物耐藥基因中具有代表性的指示基因，即磺胺類藥物的sul1基因，四環(huán)素類藥物的tetM基因，喹諾酮類藥物的aac（6’）-Ib基因，酰胺醇類藥物的floR基因，β-內(nèi)酰胺類藥物的blaTEM基因。在不同種類環(huán)境樣品中，微生物群落基因豐度呈現(xiàn)土壤樣品>底泥>水的變化趨勢（p<0.05），而耐藥基因的相對總濃度（∑ARGs）表現(xiàn)為土壤顯著高于底泥和水。在不同的采樣季節(jié)之間，微生物群落（16S rDNA）的豐度和

4、耐藥基因的相對豐度（∑ARGs copies/16S rDNAcopies）均出現(xiàn)一定的變化，但無明顯的變化規(guī)律。
　　對環(huán)境樣品的微生物結(jié)構(gòu)多樣性分析結(jié)果表明，不同種類的環(huán)境樣本在不同季節(jié)其微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性存在一定的差異，其群落優(yōu)勢細(xì)菌為變形桿菌門（Proteobacteria）、擬桿菌門（Bacteroidetes）、放線菌門（Actinobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）和綠彎菌門（Chloroflex