短膜殼絳蟲線粒體全基因組序列測(cè)定和DNA多態(tài)性研究.pdf

1、短膜殼絳蟲（Hymenolepis nana）是寄生在人或嚙齒動(dòng)物小腸內(nèi)的一種常見的人獸共患寄生蟲，能夠引起膜殼絳蟲病。盡管短膜殼絳蟲是一種人獸共患寄生蟲，并能夠在各國引起嚴(yán)重的社會(huì)經(jīng)濟(jì)問題，但短膜殼絳蟲的遺傳學(xué)、系統(tǒng)學(xué)、流行病學(xué)和生物學(xué)卻鮮為人知。短膜殼絳蟲病作為一種易于忽視的人獸共患病需引起關(guān)注。
　　本研究運(yùn)用PCR方法擴(kuò)增了來自中國7個(gè)不同地區(qū)的短膜殼絳蟲樣品的線粒體3段基因pnad5，rrnS和atp6，并根據(jù)這3段基因

2、進(jìn)行了核苷酸序列差異和多態(tài)性分析。結(jié)果顯示3段線粒體基因的長度分別是710 bp，704~711 bp和516 bp。pnad5片段的A+T％含量是70.1%~73.5%，rrnS片段的A+T%含量為70.1%~71.7%，而atp6的A+T%含量為76.6%~77.9%。種內(nèi)差異最小的片段是pnad5，為0~0.7%，atp6種內(nèi)差異為0~1.4%；rrnS種內(nèi)差異最大，為0～1.7%。將短膜殼絳蟲3段線粒體基因與縮小膜殼絳蟲（Hym

3、enolepis diminuta）相應(yīng)片段進(jìn)行序列分析，結(jié)果顯示兩者種間差異較大，rrnS片段種間差異為16.1%~17.6%；atp6種間差異為26.5%~27.1%；pnad5片段種間差異最大，為31.6%~31.7%。
　　應(yīng)用最大簡約法對(duì)3段基因的拼接序列進(jìn)行進(jìn)化分析，結(jié)果顯示分離自不同地區(qū)的短膜殼絳蟲聚在一起，僅有張家口樣品單獨(dú)位于一個(gè)進(jìn)化枝上，可見短膜殼絳蟲三段線粒體基因進(jìn)化樹中，進(jìn)化分支與地理分布沒有直接的關(guān)系，也

4、沒有一定的規(guī)律可循，來自同一地區(qū)的樣品不總在同一分支上，此進(jìn)化分析結(jié)果支持了前人對(duì)短膜殼絳蟲可能是復(fù)合種或隱藏種的結(jié)論。
　　應(yīng)用長 PCR方法對(duì)短膜殼絳蟲線粒體全基因進(jìn)行測(cè)序和基因定位。結(jié)果顯示短膜殼絳蟲線粒體全長為13764 bp，一共有36個(gè)基因和2個(gè)非編碼區(qū)。其中12為編碼線粒體蛋白質(zhì)基因、2個(gè)核糖體基因和22個(gè)tRNA基因。所有基因分布在重鏈上并沿同一個(gè)方向進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和復(fù)制。所有基因排列順序與其姊妹種縮小膜殼絳蟲（H. d

5、iminuta）一致。以12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因拼接序列應(yīng)用貝葉斯法、最大似然法和最大簡約法進(jìn)行進(jìn)化分析，結(jié)果顯示所用絳蟲線粒體基因組序列分為兩個(gè)明顯進(jìn)化枝，有較高的節(jié)點(diǎn)支持。一個(gè)是假葉目的雙葉槽科（Diphyllobothriidae）；另一個(gè)是圓葉目。其中圓葉目的帶科（Taeniidae）、膜殼科（Hymenolepididae）和復(fù)孔科（Dipylidiidae）內(nèi)分化較為明顯，獨(dú)立分支。
　　本研究測(cè)定了短膜殼絳蟲線粒體全基因