中國近海兩種鯛科魚類遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性分析.pdf

1、為了研究黃鰭鯛群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性狀況，利用PCR技術(shù)和直接測序的方法，測定了中國三個黃鰭鯛地理群體（廣東深圳市、福建廈門市和廣西北海市）共100個個體的線粒體DNA（mtDNA）D-loop控制區(qū)序列，另外，還從GeneBank中下載了22條黃鰭鯛D-loop序列，通過排列得到了427bp序列，通過研究發(fā)現(xiàn)，這些黃鰭鯛群體存在著豐富的DNA序列多態(tài)性，共檢測到106個多態(tài)性位點（24.82％），有10個插入缺失位點，轉(zhuǎn)換大于顛換。

2、122個個體有108個單倍型，單倍型多樣度范圍為0.9929～0.9952，核苷酸多樣度范圍為0.0125～0.0187。通過Nei's遺傳距離構(gòu)建的分子聚類關(guān)系樹中可看出，北海群體單獨構(gòu)成一支，而廈門群體和深圳群體構(gòu)成另外一支；通過對三個地理群體進行的分子方差分析（AMOVA），從得出的F<,st>值和p值發(fā)現(xiàn)北海群體與其他兩個群體間（廈門群體和深圳群體）存在顯著性差異（BH和XM：F<,st>=0.5483p<0.001；BH和SZ

3、：F<,st>=0.5609p<0.001），而廈門群體和深圳群體間的差異并不顯著（F<,st>＝-0.0023，p>0.05），通過Wright公式N<,m>＝（1／Fst-1）／2計算出這三個群體間的N<,m>值，可以看出廈門群體和深圳群體間存在有廣泛的基因交流（N<,m>＝204.09），而北海群體與其他兩個群體間的基因交流卻很有限（N<,m>值SZ＝0.3914，XM＝0.4119）?；诒狙芯康慕Y(jié)果認為，中國近海三個黃鰭鯛地理

4、群體應(yīng)為兩個地理種群，北海群體為一單獨種群，而廈門和深圳群體為另一種群。 利用PCR技術(shù)擴增了中國近海6個地理群體（福建省廈門市、福建省泉州市、浙江舟山市、廣東深圳市、廣西北海市和海南三亞市）215個二長棘鯛個體線粒體D-loop序列，得到了536bp片斷。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，6個地理群體內(nèi)和群體間都存在著豐富的DNA序列多態(tài)性，共檢測到91個多態(tài)性核苷酸位點（16.98％），插入缺失位點僅有5個，轉(zhuǎn)換大于顛換。215個個體共得到了191

5、個單倍型，其中共享單倍型24個。通過Arlequin2.0軟件計算了這6個地理群體的單倍型多樣性指數(shù)（h＝0.9764～1.0000）和核苷酸多樣性指數(shù)（p＝0.0120～0.0144）。根據(jù)群體間Nei's遺傳距離用UPGMA法構(gòu)建的中國近海6個二長棘鯛群體的分子聚類關(guān)系樹和以及對群體進行分子方差分析（AMOVA），可以看出，變異主要發(fā)生在群體間的個體內(nèi)（99.84％），僅有很少變異發(fā)生在群體間（0.16％），這6個地理群體間并不存在