兩種水稻黑條矮縮病毒在我國(guó)的分布及其遺傳多樣性.pdf

1、近年來，水稻黑條矮縮病毒(Rice black-streaked dwarf virus，RBSDV)和南方水稻黑條矮縮病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus，SRBSDV)成為危害我國(guó)水稻和玉米生產(chǎn)的兩種重要病毒，造成了嚴(yán)重?fù)p失。為了探明這兩種病毒在我國(guó)的分布，我們于2009～2010年期間，利用RT-PCR技術(shù)對(duì)采自我國(guó)廣東、福建、江西、浙江、湖南、江蘇、安徽、山東、河北等共計(jì)17個(gè)省

2、份，161個(gè)市/縣/區(qū)的1524份表現(xiàn)為矮縮癥狀的水稻、玉米植株進(jìn)行了檢測(cè)。其中1414份樣品采自水稻田，涉及313個(gè)水稻品種，110份樣品采白玉米田。檢測(cè)結(jié)果顯示21.00％的樣品感染RBSDV，55.97％的樣品感染SRBSDV。RBSDV主要在上海、江蘇、山東、河北、浙江、安徽、江西等地為害水稻和玉米。尤其在江蘇地區(qū)，RBSDV幾乎遍布全省。SRBSDV主要在以種植秈稻為主的長(zhǎng)江以南地區(qū)為害水稻，在南方的13個(gè)省份、115市/縣/

3、區(qū)均檢測(cè)到該病毒。在水稻播種期與白背飛虱主要遷入期間隔一個(gè)月左右及種植方式多樣化的地區(qū)SRBSDV分布更為廣泛。兩種病毒可侵染常規(guī)粳稻、常規(guī)秈稻、雜交粳稻、雜交秈稻、常規(guī)糯稻等，生產(chǎn)中尚未見對(duì)這兩種病毒高抗的水稻類型或品種。
　　 在明確我國(guó)RBSDV分布情況的基礎(chǔ)上，同時(shí)選取部分分離物通過核苷酸序列測(cè)定方法對(duì)其CP、S7-ORF1和S5-ORF2進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明，RBSDVCP遺傳多樣性值為0.0400，系統(tǒng)發(fā)育

4、樹表明各地分離物可明顯的分為兩組；S7-ORF1序列的遺傳多樣性值為0.0179，不同分離物也可分為兩組，多數(shù)分離物都聚集在一組內(nèi)，與中國(guó)分離物的核苷酸和氨基酸序列相似性在98％以上，個(gè)別分離物的核苷酸和氨基酸序列與日本分離物的相似性較高，分別為94.3～99.0％和98.5～100％；S5-ORF2的遺傳多樣性值為0.0285，各地分離物也可以明顯的分為兩組。RBSDV分離物CP，S5-ORF2的分組情況與地理來源有一定的相關(guān)性，多數(shù)

5、來源于北方玉米種植區(qū)的分離物聚于一組而來源于地理位置偏南以種植水稻為主的地區(qū)的分離物聚于一組。來源于山東、江蘇地區(qū)的分離物的CP、S5-ORF2遺傳多樣性水平相對(duì)較高。同一分離物不同片段的分組情況和遺傳多樣性水平也不相同。三個(gè)片段在遺傳多樣性方面CP>S5-ORF2>S7-ORF1。三者的進(jìn)化限制系數(shù)ω值依次為0.0488、0.0394、0.4278，在受到的選擇壓力方面：S7-ORF1>CP>S5-ORF2。S7-ORF1序列的高度保

6、守性可能與其編碼蛋白的功能有關(guān)。
　　 采用類似方法對(duì)采自我國(guó)13個(gè)省份的SRBSDV水稻、玉米分離物的S10-ORF，S7-OR目的變異情況進(jìn)行了分析。將測(cè)定的我國(guó)SRBSDV分離物的CP和S7-ORF1序列與從Genbank中獲得的越南分離物比較，發(fā)現(xiàn)無論是我國(guó)的分離物是越南的分離物，這兩個(gè)片段不同分離物之間的核苷酸序列和氨基酸序列的相似性都較高，均在97％以上，不同地理和寄主來源的分離物間差異較小。兩個(gè)片段的核苷酸遺傳多樣