整合基因共表達網絡和代謝網絡預測新癌癥靶點及潛在抗癌藥物.pdf

1、代謝對于癌癥至關重要。在癌細胞中，許多代謝通路被重調，以適應癌癥的特異需求，或促進癌癥的發(fā)生發(fā)展。本研究整合了癌癥基因共表達網絡和代謝酶網絡，以深入探索癌細胞代謝過程。通過癌癥基因共表達網絡，我們找出了在癌細胞中顯著上調或下調的基因共表達模塊。模塊中有一些酶基因具有比預期更多的基于代謝酶網絡的連接數，我們認為，這些酶的表達及活性水平的改變、或針對相應代謝物水平的干預可能對癌細胞代謝過程具有重要影響。因而，這些酶基因及相應代謝物具有成為癌

2、癥治療靶點和藥物的潛能。我們將此整合網絡的方法稱為Met-express，其中Meta指代謝酶網絡，而express指基因共表達網絡。Met-express被用于肺癌、白血病和乳腺癌中，對每一種癌癥都預測了一系列關鍵酶基因和關鍵代謝物。依據數據庫和文獻搜索，我們發(fā)現大約20-30％的關鍵酶基因被用作已知治療癌癥藥物的靶點，或有文獻認為其具有成為新靶點的可能。另外，有50個代謝物出現在所有三種癌癥預測結果中，其中4個是已知的治療癌癥藥物，