金華豬經(jīng)濟(jì)性狀選擇信號探測.pdf

1、金華豬歷史上經(jīng)歷了上千年的自然及人工選擇，是珍貴的研究肉質(zhì)、抗病力、生產(chǎn)、繁殖性狀的模型豬種。杜洛克，長白豬，大白豬是歐洲知名的商業(yè)豬種，經(jīng)歷了長期系統(tǒng)化的人工選擇來滿足市場需求，而金華豬和其他六個中國豬種是中國東南部浙江省本土長期馴養(yǎng)的地方豬種，成長于相對孤立的環(huán)境，所以保留了一些獨特的高頻率有利等位基因及經(jīng)濟(jì)性狀。此項研究的目的是利用491頭中外豬種2％的全基因組測序的108603個SNP位點，通過金華豬種分別與國外豬種和其他六個中

2、國地方豬種對比探測金華豬和其他豬種間選擇印記的區(qū)別（6個中國地方豬種和3個國外豬種作為參考對照組）。我們用多群體單倍型純合性檢測(XP-EHH)方法揭示了金華豬和其他豬種間顯著差異的選擇信號。一些候選基因如GH，CRHE，TRAF4，和CCK被發(fā)現(xiàn)與肉質(zhì)，健康，以及繁殖性狀有關(guān)。此外，研究顯示金華豬與肉質(zhì)，免疫應(yīng)答和繁殖性狀有關(guān)的基因組區(qū)域在馴養(yǎng)和連續(xù)的人工育種過程中發(fā)生了正向選擇。被檢測出的發(fā)生正向選擇的基因和相應(yīng)的生物路徑表明金華豬