“計算中藥學”在中藥藥性及復方研究中的應用.pdf

1、中藥物種的多樣性和多元性,中藥成分的豐富性和復雜性,中藥配伍的靈活性和多變性,中藥信息資源的急劇增長和海量資料的挖掘和整理,中藥研究現(xiàn)有實驗技術(shù)的局限和不足等等,決定了中藥研究不可想象的復雜性和艱巨性。我們認識到要正確理解構(gòu)成中藥復雜系統(tǒng)的要素(組成成分)、要素間的相互作用及其個體和整體的效應,需要改變常規(guī)的思維方式,在現(xiàn)有的醫(yī)藥學實驗科學方法的基礎上,應用計算科學及其方法,處理中藥研究中關鍵的科學問題。因此,本論文提出了“計算中藥學”

2、這一新的學科概念?！坝嬎阒兴帉W”致力于計算、信息技術(shù)在中藥研究領域的應用,對常規(guī)實驗無法觸及的領域和由來已久的技術(shù)難題給出合理而獨具特色的研究思路與方案,對中醫(yī)藥領域的抽象概念和高度概括的理論講述給出科學而定量的實驗證據(jù)。
　　 本論文詳細介紹了“計算中藥學”的概念內(nèi)涵、基本原理、研究方法和研究意義。在此基礎上,將“計算中藥學”具體應用到中藥的四氣五味、配伍禁忌等中藥藥性,以及中藥復方藥效物質(zhì)基礎的研究中,使“計算中藥學”的應用

3、與研究更加深入。本論文的主要研究內(nèi)容如下:
　　 1)中藥化學數(shù)據(jù)庫的建立。運用ISIS/Base軟件的數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建與管理功能,建立了一個中藥化學數(shù)據(jù)庫,該數(shù)據(jù)庫以中藥藥材為單位,包含了各中藥的化學成分信息及其二維、三維結(jié)構(gòu)信息。該數(shù)據(jù)庫共計錄入常見中藥374味,中藥化學成分分子約12000多個。
　　 2)中藥寒熱預測系統(tǒng)的構(gòu)建。綜合運用數(shù)據(jù)庫查詢、化學描述符計算、重心處理技術(shù)(原創(chuàng))、支持向量機分類技術(shù)構(gòu)建了一個中藥寒

4、熱預測系統(tǒng),預測準確率達到80％以上,可用于民間草藥和外國草藥寒熱性質(zhì)的預測。同時,該系統(tǒng)對中藥寒熱性質(zhì)與其化學成分物化性質(zhì)之間的聯(lián)系給出了新的詮釋。
　　 3)辛味中藥與嗅覺受體相互作用的研究。通過GPCR的同源模建、分子動力學的綜合運用,首次構(gòu)建了三個嗅覺受體的三維模型,并以之為模板與辛味中藥的化學成分進行分子對接,發(fā)現(xiàn)嗅覺受體的刺激很可能是辛味中藥發(fā)揮藥效的第一個環(huán)節(jié),而這種作用是通過正性的激動作用而產(chǎn)生。
　　

5、4)方劑網(wǎng)絡與化學空間對中藥配伍禁忌的研究。分別采用復雜網(wǎng)絡技術(shù)和化學空間技術(shù)構(gòu)建了中藥方劑網(wǎng)絡和中藥化學空間,并將其運用到中藥方劑配伍禁忌的分析之中,對“十八反十九畏”配伍禁忌的經(jīng)驗法則給出了科學的解釋。
　　 5)復方血必凈治療膿毒癥的藥效物質(zhì)基礎研究。繪制并分析了膿毒癥發(fā)病機制的效應網(wǎng)絡,從中挑選出關鍵的病理靶點,運用虛擬篩選技術(shù)對復方血必凈治療膿毒癥的藥效物質(zhì)基礎進行了全面的搜索和篩選,最后找到數(shù)個頗有潛力的單體分子,將