基因芯片分析的方法研究及其應(yīng)用系統(tǒng)實(shí)現(xiàn).pdf

1、芯片分析是基因芯片技術(shù)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),分析的可靠性直接影響基因芯片的應(yīng)用.該文從圖象分析和數(shù)據(jù)分析兩個(gè)方面,深入研究了影響芯片分析的因素,實(shí)現(xiàn)了對(duì)雜交熒光圖象的信號(hào)提取、生物信息分析.針對(duì)雜交圖象中污點(diǎn)、噪聲形狀、灰度變化大的特點(diǎn),該文引入模糊形態(tài)學(xué)的方法成功地抑制了污點(diǎn)、噪聲等雜散信號(hào)的干擾.同時(shí)該方法對(duì)于熒光猝滅所造成的信號(hào)點(diǎn)中空現(xiàn)象具有較好的彌補(bǔ)作用.在網(wǎng)格定位中,該文針對(duì)信號(hào)點(diǎn)不規(guī)則的芯片圖象提出了三種基于圖象分割的自動(dòng)定位方法:邊

2、緣檢測和邊緣連接法、閾值分割法以及基于前兩者的組合法.在信號(hào)強(qiáng)度計(jì)算中,該文研究了背景、計(jì)算方法、歸一化三個(gè)問題,提出了背景濾除、歸一化的解決方案,并針對(duì)不同的定位方法提出不同的計(jì)算方法以確保信號(hào)點(diǎn)熒光強(qiáng)度提取的準(zhǔn)確性.對(duì)于不同應(yīng)用的芯片,其數(shù)據(jù)分析的方法也不同.該文針對(duì)突變型芯片和表達(dá)型芯片分別進(jìn)行了研究.最后該文在上述方法的基礎(chǔ)上實(shí)現(xiàn)了基因芯片分析系統(tǒng)GAS V1.0.該系統(tǒng)能快速準(zhǔn)確地提取信號(hào)點(diǎn)的雜交信號(hào),并結(jié)合探針信息,分析芯片