基因芯片分析的方法研究及其應用系統(tǒng)實現.pdf

1、芯片分析是基因芯片技術的關鍵環(huán)節(jié),分析的可靠性直接影響基因芯片的應用.該文從圖象分析和數據分析兩個方面,深入研究了影響芯片分析的因素,實現了對雜交熒光圖象的信號提取、生物信息分析.針對雜交圖象中污點、噪聲形狀、灰度變化大的特點,該文引入模糊形態(tài)學的方法成功地抑制了污點、噪聲等雜散信號的干擾.同時該方法對于熒光猝滅所造成的信號點中空現象具有較好的彌補作用.在網格定位中,該文針對信號點不規(guī)則的芯片圖象提出了三種基于圖象分割的自動定位方法:邊

2、緣檢測和邊緣連接法、閾值分割法以及基于前兩者的組合法.在信號強度計算中,該文研究了背景、計算方法、歸一化三個問題,提出了背景濾除、歸一化的解決方案,并針對不同的定位方法提出不同的計算方法以確保信號點熒光強度提取的準確性.對于不同應用的芯片,其數據分析的方法也不同.該文針對突變型芯片和表達型芯片分別進行了研究.最后該文在上述方法的基礎上實現了基因芯片分析系統(tǒng)GAS V1.0.該系統(tǒng)能快速準確地提取信號點的雜交信號,并結合探針信息,分析芯片