稻屬AA基因組復(fù)合體中mariner-like elements基因家族研究.pdf

1、中山大學(xué)碩士學(xué)位論文- y 7 6 7 7 2 2稻屬A A 基因組復(fù)合體中m a r i n e r - l i k ee l e m e n t s 基因家族研究答辯委員會主席：委員：何敬洪導(dǎo)師：施蘇華教授專業(yè)：植物學(xué)學(xué)位授了；單位：中山大學(xué)研究生院，廣州二0 0 五年五月f - 山大學(xué)碩士論文 稻屬A A 基因組復(fù)合體中M a r i n e r ．1 i k e e l e m e n t s 基因家族研究 何墩洪也有區(qū)域差別，

2、在催化區(qū)域的中間部位出現(xiàn)較多的是M I T E ( D N A —D N A 的非自主性轉(zhuǎn)座予) 類型的內(nèi)含予，在催化區(qū)域末端區(qū)域出現(xiàn)較多的是反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子類型的內(nèi)含子。內(nèi)含子出現(xiàn)位置的特異性以及長度的一致性，證明了內(nèi)含子“后起源”的觀點。遺傳分化系數(shù)F s t 顯示O ．r u f i p o g o n 、i n d i c a 與j a p o n i c a 兩個亞種已經(jīng)完全分化，因此要分別作為單獨種群討論。核苷酸多樣性( n )

3、 與核苷酸多態(tài)性( o )數(shù)據(jù)結(jié)果顯示，M L E s 在催化區(qū)域的遺傳分化程度比D N A 結(jié)合區(qū)域要高。序列分析發(fā)現(xiàn)，在D N A 結(jié)合區(qū)域產(chǎn)生了大片斷的插入缺失，引起統(tǒng)計上的誤差，N J樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)也很大區(qū)別。中性檢測表明，M L E s 的D N A 結(jié)合區(qū)域處于選擇中性，然而催化區(qū)域存在平衡選擇( b a l a n c i n gs e l e c t i o n ) ，推測是因為M L E s 在這個區(qū)域功能保守導(dǎo)致。雖然