楊樹與玉米細(xì)胞周期蛋白基因家族全基因組研究.pdf

1、植物細(xì)胞周期蛋白家族基因的研究是近年來植物遺傳學(xué)和分子生物學(xué)所關(guān)注的熱點問題。綜述部分主要介紹了近年來植物細(xì)胞周期蛋白的研究進(jìn)展，包括細(xì)胞周期過程，細(xì)胞周期調(diào)控，細(xì)胞周期蛋白依賴激酶(CDK)，細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶抑制因子(CKI)和細(xì)胞周期素(cyclin)。此外，對近幾年研究的細(xì)胞周期蛋白家族的前景進(jìn)行了簡要的評述。另一方面，生物信息學(xué)作為計算機科學(xué)與生物學(xué)的交叉學(xué)科，生物數(shù)據(jù)庫及生物信息分析是其主要研究內(nèi)容。綜述部分概述了核酸數(shù)

2、據(jù)庫、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫及其集成系統(tǒng)，并簡介生物信息學(xué)在植物細(xì)胞周期蛋白家族研究中常用的信息學(xué)軟件，例如序列分析軟件——DNATOOLS，序列多種排列軟件——ClustalW/X，系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建軟件——MAGA以及MEME。細(xì)胞周期蛋白家族是細(xì)胞周期蛋白依賴激酶(CDK)的正向調(diào)控因子，并在細(xì)胞周期調(diào)控中發(fā)展著重要作用。盡管有研究已經(jīng)揭示了一些植物cyclin基因的功能和機制，但是在玉米中被研究的cyclin基因數(shù)量還是相當(dāng)稀少。
　　

3、 在研究論文部分中，對玉米中含cyclinN結(jié)構(gòu)域的候選基因進(jìn)行了全基因組的分析研究，這包括對它們的確認(rèn)、系統(tǒng)發(fā)生學(xué)關(guān)系分析、物理位置分布分析、保守序列分析、基因復(fù)制研究等等，并且對水稻細(xì)胞周期蛋白家族基因分析結(jié)果進(jìn)行對照，取得如下結(jié)果：
　　 1．我們在玉米B73品種中找到了59個cyclin基因，根據(jù)進(jìn)化樹分析，將這59個基因分為A，B，D，F(xiàn)，SDS和T六個亞族，相應(yīng)地，每個亞族成員的數(shù)目分別為11，10，21，6，4，

4、和7。
　　 2．在水稻與玉米cyclin基因構(gòu)造的進(jìn)化樹中，六個類型亞族（A，B，D，F(xiàn)，T和SDS亞族）為水稻和玉米共有，水稻中含有H，L和P亞族，而玉米中沒有發(fā)現(xiàn)這三個亞族。
　　 3．研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)在玉米的五條染色體中，cyclin基因經(jīng)歷了7組串聯(lián)基因復(fù)制事件，然而與水稻不同的是，玉米中并沒有發(fā)現(xiàn)片段基因復(fù)制。
　　 4．在楊樹中找到了50個cyclin基因，根據(jù)進(jìn)化樹分析，被分為A、B、C、D、T、J