應用cDNA宏陣列技術發(fā)現(xiàn)豬某些產(chǎn)肉性狀的候選基因.pdf

1、該論文利用cDNA宏陣列(cDNA Macroarray)技術分析了來源于豬肌肉組織cDNA文庫的327個EST克隆在胚胎發(fā)育期差異表達的基因,燕對部分差異表達基因進行了比較深入的探討,取得了如下結果:1.對cDNA Macroarray技術的相關技術條件進行了優(yōu)化,在該研究室建立了大規(guī)模陣列表達數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析方法.2.首次發(fā)現(xiàn)血紅蛋白相關基因的表達隨著骨骼肌細胞分化的完成表達水平呈現(xiàn)顯著的差異下調表達.3.進一步證實了絕大多數(shù)核糖體組

2、成因子在細胞分化前后呈現(xiàn)下調表達的規(guī)律,該研究結果發(fā)現(xiàn)有12個核糖體組成因子的表達水平發(fā)生了改變.4.層次聚類法聚類結果表明來源于同一基因的EST聚在一起,如UniGene Cluster(Ssc.7157)中的17個EST中,僅E3-aae-b-06沒有聚在一類;功能相近的基因被聚類在一起,如與核糖體相關基因的EST聚在一起.5.采用cDNA末端快速擴增方法獲得了差異表達EST M165,M63的cDNA序列,部分獲得了EST M21

3、8的3′端序列,并獲得了EST M165同源基因caveolin-3的全長cDNA克隆.6.表達譜分析結果顯示caveolin-3是一個骨骼肌特異表達因子,僅在骨骼肌組織和心臟器官中表達.7.用豬×嚙齒類體細胞雜種板將三個新分離的豬差異表達基因進行染色體區(qū)域定位,用豬輻射雜種板進行染色體精細定位.8.采用PCR-RFLP分析技術,在不同豬群體中檢測了PNAS-4的Kpn Ⅰ-RFLP,M218的AccⅡ-RFLP多態(tài)性,計算了基因型頻率