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1、本課題針對(duì)傳支病毒S基因的高變性,參考genebank已發(fā)表的IBV纖突蛋白基因序列,設(shè)計(jì)了三對(duì)引物,對(duì)雞傳染性支氣管炎病毒黑龍江腎型分離株MG/MK/K和澳大利亞標(biāo)準(zhǔn)株Υ株RNA進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,并將擴(kuò)增后得到的PCR產(chǎn)物克隆入pMD-18T克隆載體中進(jìn)行序列測(cè)定和分析。結(jié)果顯示為IBVS基因。測(cè)序分析顯示,S基因的核苷酸全長(zhǎng)為3498bp,編碼一條由1166個(gè)氨基酸組成的多肽,S1基因是IBV的高變區(qū)序列,S2基因相對(duì)比較保守,
2、3'端核苷酸相對(duì)于5'端保守,與網(wǎng)上報(bào)道的相一致。地方分離株MG株、MK株、K株分別和標(biāo)準(zhǔn)株T株比較,其同源性分別為89.2%、91.9%和91.4%。而MG和MK株的同源性為96.4%,MG和K株的同源性為95.7%,MK和K株的同源性為99.3%。地方分離株的親緣關(guān)系較近,而和T株的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。MK和K株還可能是由同一株病毒變異而來(lái),或者是同一株病毒在傳代的過(guò)程中發(fā)生了點(diǎn)突變?cè)斐傻?。S基因的克隆與測(cè)序添補(bǔ)了國(guó)內(nèi)在IBV序列數(shù)據(jù)上的
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