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1、IillIlllIIIillIIIIIIIIIIilLllIlllIIILIIY2974941IDENTIFICATIONANDEXPERIMENTALVALIDATIONOFRNAEDITINGSITESINDMONDBACKMOTHbyLEIWENJIEAThesisSubmittedtoNanjingAgriculturalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheM
2、asterDegreeofAgricultureScienceSupervisedbyProfLiFeiDepartmentofEntomologyCollegeofPlantProtectionNanjingAgriculturalUniversityNanjing210095PRChinaMav2014目錄目錄摘要IABSTRACTIH第一章文獻(xiàn)綜述111小菜蛾112RNA編輯的研究進(jìn)展2121RNA編輯2122基于第二代測(cè)序技術(shù)的
3、RNA編輯研究3第二章小菜蛾RNA編輯位點(diǎn)的識(shí)別721數(shù)據(jù)與計(jì)算方法8211數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件一8212基因數(shù)據(jù)一8213序列比對(duì)及軟件參數(shù)設(shè)置822結(jié)果9221小菜蛾RNASeq比對(duì)結(jié)果9222構(gòu)建潛在的RNA編輯位點(diǎn)集9223對(duì)潛在的RNA編輯位點(diǎn)集篩選過濾一,D1)濾除落在3’、5’端位點(diǎn),J2)濾除來自同庫(kù)的重復(fù)序列J23)濾除編輯效率低及覆蓋度過低的位點(diǎn)J24)濾除替換類型不確定的編輯位點(diǎn)門5)濾除剪接位點(diǎn)周圍的RNA編輯位點(diǎn)J36
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