基于E-bayes的胚乳性狀QTL上位性的研究.pdf

1、禾谷類作物對于人類，尤其是亞洲大陸的居民來說是不可缺的重要食材。而胚乳作為谷類作物種子的重要組成部分，其中含有豐富的蛋白質，氨基酸，淀粉等等一系列人體必須的營養(yǎng)物質。因此進行胚乳性狀的分析研究，對禾谷類作物產量提高和品質改良是至關重要的。胚乳性狀的遺傳構成與普通二倍體植物不同，是由兩個極核和一個精核結合發(fā)育形成的三倍體，因此胚乳的遺傳成分更為復雜。胚乳性狀QTL可分解出三種遺傳效應：加性效應，第一顯性效應和第二顯性效應。目前，雖然很多學

2、者提出了各種QTL定位研究方法，然胚乳性狀QTL上位性研究還較少。
　　本研究根據胚乳性狀三倍體倍性特點，提出了兩種胚乳性狀QTL定位的研究方法，即：在谷類作物 BC1.1（以 F1為父本，P1為母本的回交一代），BC1.2（以 F1為父本，P2為母本的回交一代）和F2群體中，基于多元方差分量模型對胚乳性狀QTL主效應進行研究；基于不同先驗分布（逆卡方先驗和指數先驗）的經驗貝葉斯（E-bayes）統(tǒng)計方法，對胚乳性狀 QTL的上位

3、性研究，并通過計算機模擬加以驗證。主要內容如下：
　　1.對于胚乳性狀QTL主效應分析，假設在同一環(huán)境下，隨機效應（加性效應，第一顯性和第二顯性）具有相同的方差，且與環(huán)境方差成比例，由此提出基于多元方差分量模型。仿真模擬研究表明，基于多元方差分量模型能夠準確地定位各個QTL位置，并且有效地對胚乳性狀QTL加性效應，兩類顯性效應（第一顯性效應和第二顯性效應）進行無偏估計。
　　2.對于胚乳性狀 QTL的上位性分析，基于兩種不同