基于遺傳標(biāo)記的烏骨山羊群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究.pdf

1、本研究利用14個SNP作為遺傳標(biāo)記，通過PCR-SSCP和PCR-RFLP實(shí)驗(yàn)技術(shù)基因分型，基于基因頻率利用軟件分析，從分子水平研究烏骨山羊群體遺傳結(jié)構(gòu)及烏骨山羊與酉州烏羊，麻城黑山羊、南江黃羊和波爾山羊之間的親緣關(guān)系，旨在為烏骨山羊選育工作提供參考。
　　 研究結(jié)果如下:
　　 1.14個SNP位點(diǎn)在烏骨山羊群體中觀察雜合度(Ho)平均為0.3463;期望雜合度(He)平均為0.3449;有效等位基因數(shù)(Ne)平均為1

2、.5830;群體多態(tài)信息含量（PIC平均為0.2754;Shannon指數(shù)平均為0.5125。
　　 2.在研究群體中相同的14個SNP標(biāo)記，烏骨山羊的平均有效等位基因、雜合度，多態(tài)信息含量和Shannon指數(shù)(1.5830、0.3463、0.2754、0.5125)均比與酉州烏羊(1.4634、0.3211、0.2305、0.4336)，麻城黑山羊(1.4137、0.3027、0.2110、0.4015)，南江黃羊(1.389

3、3、0.2262、0.2085、0.3968)，波爾山羊(1.4253、0.2459、0.2052、0.3903)高。
　　 3.烏骨山羊和其它四個山羊群體間的F檢驗(yàn)結(jié)果Fst和Fit分別為0.1468和-0.0245表明14.68％的遺傳變異是由不同的山羊群體間引起的，85.32％遺傳變異是由各群體內(nèi)引起的，2.45％的遺傳變異來自遠(yuǎn)交。
　　 4.Nei標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離聚類分析，烏骨山羊和波爾山羊之間遺傳距離最遠(yuǎn)(Ds=

4、0.1942)，兩者的遺傳一致性系數(shù)最小（I=0.8235）;烏骨山羊和麻城黑山羊遺傳距離最近(Ds=0.0720)，對應(yīng)的遺傳一致度系數(shù)最大(I=0.9305);此外，烏骨山羊等四個地方品種聚為一類，波爾山羊單獨(dú)聚為一類。
　　 5.本研究通過逐漸突變模型下的群體期望雜合度和基因每個世代的平均突變率估算烏骨山羊群體的規(guī)模大約為1.6萬頭，有效群體含量約900頭，從數(shù)量上看烏骨山羊處于安全狀態(tài)。實(shí)際中，這些群體被分散在廣大地區(qū)，