中華鱉4個(gè)不同種群的遺傳結(jié)構(gòu)和分子遺傳標(biāo)記研究.pdf

1、中華鱉作為浙江省六大優(yōu)勢(shì)養(yǎng)殖品種之一，是一種具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的漁業(yè)資源。隨著養(yǎng)鱉業(yè)的飛速發(fā)展，中華鱉資源也出現(xiàn)了種質(zhì)混雜和退化現(xiàn)象。迄今對(duì)我國(guó)各地方代表性中華鱉的研究多集中在形態(tài)、養(yǎng)殖性能及免疫力等方面，從分子水平上對(duì)中華鱉不同地理種群遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)的研究并不多見。種群遺傳學(xué)是中華鱉資源利用和保護(hù)的基礎(chǔ)，本文采用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA分析、線粒體細(xì)胞色素b基因序列比較分析和酪氨酸酶基因第一外顯子PCR-RFLP分析方法，從DNA分子水

2、平上對(duì)中華鱉4個(gè)不同種群(太湖種群、日本種群、烏鱉種群和臺(tái)灣種群)的遺傳結(jié)構(gòu)和分子遺傳標(biāo)記進(jìn)行了研究。 1、應(yīng)用RAPD技術(shù)對(duì)中華鱉4個(gè)不同地理種群進(jìn)行種群內(nèi)和種群間的遺傳差異分析。利用23條隨機(jī)引物，在4個(gè)種群中共檢測(cè)出162個(gè)RAPD位點(diǎn)，其中多態(tài)位點(diǎn)110個(gè)。數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示：中華鱉總的DNA多態(tài)位點(diǎn)百分率占67.90﹪，不同種群多態(tài)位點(diǎn)比例在48.70﹪～52.94﹪之間；其中，太湖種群最高，日本種群最低；種群內(nèi)的遺傳相

3、似度由高到低依次為日本種群(0.8469)＞臺(tái)灣種群(0.8429)＞烏鱉種群(0.8317)＞太湖種群(0.8254);太湖種群和烏鱉種群之間遺傳距離最大(0.1375)，臺(tái)灣種群和烏鱉種群之間遺傳距離最小(0.0707);中華鱉總基因多樣性為0.2368，種群內(nèi)基因多樣性為0.1699，表明中華鱉大部分遺傳變異(71.75﹪)存在于種群內(nèi)；有28.25﹪的變異來自種群間，種群間的遺傳分化系數(shù)為0.2827，種群間也產(chǎn)生了一定的分化；

4、根據(jù)遺傳距離，用UPGMA和NJ法進(jìn)行聚類分析，表明太湖種群與日本種群聚為一支，臺(tái)灣種群與烏鱉種群則聚為另一支，然后這兩支再聚在一起。 2、利用線粒體細(xì)胞色素b基因序列對(duì)中華鱉4個(gè)不同地理種群的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。以特異引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，獲得了408bp的基因片段序列。序列分析結(jié)果表明，在32個(gè)中華鱉個(gè)體中，共檢測(cè)到17個(gè)變異位點(diǎn)，獲得8種單倍型。日本種群的2種單倍型在其他3個(gè)種群中都未檢測(cè)到，為該種群所特有。除日本種群缺乏主體

5、單倍型外，其他3個(gè)種群均有主體單倍型Hap.1。烏鱉種群或臺(tái)灣種群的單倍型類型都和其他種群共同享有，沒有特異的單倍型。MP法和NJ法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹顯示日本種群的兩種單倍型以很高的置信度聚成一支，這與其地理分布存在一定的相關(guān)性，其序列差異可以成為種群鑒別的分子標(biāo)記；另外3個(gè)種群的6種單倍型聚合成一大支，但同一個(gè)地理區(qū)域的種群并未聚成一類，未按照地理位置形成明顯的地理格局。 3、腹部烏黑是烏鱉種群的主要烏質(zhì)性狀。酪氨酸酶是黑色素合