棘胸蛙微衛(wèi)星分子標(biāo)記篩選及其種群遺傳分析.pdf

1、全球范圍內(nèi)兩棲動(dòng)物種群已呈衰退趨勢(shì)，保護(hù)形勢(shì)嚴(yán)峻。兩棲動(dòng)物非常適合于種群動(dòng)態(tài)和保護(hù)生物學(xué)相關(guān)問題的研究，一直被作為生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)的重要指示類群。對(duì)于中國境內(nèi)的大多數(shù)無尾兩棲動(dòng)物而言，生物多樣性保護(hù)優(yōu)先區(qū)的確定和評(píng)估都缺乏基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，同時(shí)由于兩棲動(dòng)物相對(duì)較弱的遷徙能力，針對(duì)一些中國特有種的研究具有重要的研究價(jià)值。棘胸蛙(Paa spinosa)，廣泛分布于我國長江以南，少量分布于越南北部地區(qū)。棘胸蛙具有很高的營養(yǎng)價(jià)值，是國內(nèi)重要的養(yǎng)殖蛙類之一

2、，但是野生種群破壞嚴(yán)重，是中國境內(nèi)的珍稀瀕危保護(hù)動(dòng)物，同時(shí)也是世界自然保護(hù)聯(lián)盟(IUCN)評(píng)估的全球性易危種。針對(duì)棘胸蛙的遺傳標(biāo)記開發(fā)和種群遺傳研究既有助于該物種的保護(hù)，也是開展中國兩棲動(dòng)物系統(tǒng)地理研究的基礎(chǔ)性研究。本文應(yīng)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記研究13個(gè)棘胸蛙地理種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)，主要研究內(nèi)容如下： 利用磁珠富集法從棘胸蛙富集文庫中成功篩選出15個(gè)微衛(wèi)星高度多態(tài)性位點(diǎn)。位點(diǎn)平均等位基因數(shù)目為9-23，觀測(cè)雜合度和期望雜合度分

3、別為0.393-0.906和0.432-0.955。這些多態(tài)性標(biāo)記將為棘胸蛙種群的遺傳多樣性，種群遺傳結(jié)構(gòu)，基因流，親子鑒定等研究提供一個(gè)有力的工具。 利用已篩選的12個(gè)多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記評(píng)價(jià)了分布區(qū)內(nèi)13個(gè)自然種群共210個(gè)樣本的遺傳多樣性和遺傳分化。分析結(jié)果顯示，棘胸蛙群體的遺傳多樣性非常豐富，在所有的12個(gè)位點(diǎn)上共擴(kuò)增得到206個(gè)等位基因，平均每個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增得到17.15個(gè)。群體的平均期望雜合度分別為0.7212(0.676-

4、0.892)。不同的地理群體之間有較大的遺傳分化(FST=0.114)。采用基于貝葉斯法的聚類算法分析數(shù)據(jù)，顯示本實(shí)驗(yàn)涉及的樣本由中國西部、中國中部、中國東部三個(gè)遺傳單元構(gòu)成。采用鄰接法分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹也支持上述結(jié)果。各遺傳單元和其地理分布基本一致。分子變異分析(AMOVA)顯示各個(gè)遺傳單元具有高度的遺傳差異，并且各單元之間顯示較低的基因流。同時(shí)在在12個(gè)座位中，我們發(fā)現(xiàn)多個(gè)等位基因?yàn)槟硢卧赜?，揭示了各遺傳單元之間可能存在生殖隔