基于rDNA序列研究土生空?qǐng)F(tuán)菌的遺傳多樣性.pdf

1、土生空?qǐng)F(tuán)菌（Cenococcum geophilum Fr.）是一種重要的外生菌根真菌，具有突出的抗旱性。其地理分布和寄主范圍都非常廣泛。目前，國(guó)內(nèi)關(guān)于土生空?qǐng)F(tuán)菌遺傳多樣的研究還很少，因此，本文對(duì)35個(gè)中國(guó)菌株和4個(gè)法國(guó)菌株的rDNA ITS區(qū)域和18S、28S rDNA中I型內(nèi)含子進(jìn)行測(cè)序，結(jié)合GenBank的相關(guān)數(shù)據(jù)，分析其核苷酸序列差異和RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)特征，進(jìn)一步研究影響土生空?qǐng)F(tuán)菌遺傳分化的因素。主要結(jié)果如下：
　　1、土生

2、空?qǐng)F(tuán)菌rDNA ITS區(qū)序列長(zhǎng)度為422bp~447bp，顯示出93.8%~100%的同源性。其中ITS1和ITS2區(qū)均可形成穩(wěn)定的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)，表明它們?cè)趓RNA轉(zhuǎn)錄后加工中發(fā)揮著作用。系統(tǒng)發(fā)育分析表明每個(gè)地區(qū)的土生空?qǐng)F(tuán)菌都有一定的遺傳多樣性；其中聚在一起的菌株基本來源于相同地理區(qū)域，而菌株的親緣關(guān)系與寄主沒有明顯相關(guān)性。
　　2、34個(gè)中國(guó)土生空?qǐng)F(tuán)菌有22個(gè)菌株在18S rDNA中有I型內(nèi)含子。序列分析表明18S rDNA中

3、的I型內(nèi)含子序列長(zhǎng)度為488bp~590bp。其5’端序列比較保守，3’端序列有差異。二級(jí)結(jié)構(gòu)顯示I型內(nèi)含子有10個(gè)配對(duì)區(qū)（P1~P10），P5區(qū)域由P5，P5a，P5b，P5c，P5d組成，P9的3’端有2個(gè)配對(duì)區(qū)（P9.1、P9.2）。系統(tǒng)發(fā)育分析表明每個(gè)地區(qū)的土生空?qǐng)F(tuán)菌有一定的遺傳多樣性；其中遺傳多樣性和地理區(qū)域有很大的關(guān)系，和寄主沒有明顯相關(guān)性。
　　3、34個(gè)中國(guó)土生空?qǐng)F(tuán)菌有21個(gè)菌株在28S rDNA中有I型內(nèi)含子。2